Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29,23■■■□□ 2,27
Ifnar1P33896 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Ifnar1P33896 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Ifnar1P33896 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Ifnar1P33896 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29,2■■■□□ 2,26
Ifnar1P33896 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Ifnar1P33896 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Ifnar1P33896 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Ifnar1P33896 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Ifnar1P33896 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,12■■■□□ 2,25
Ifnar1P33896 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29,1■■■□□ 2,25
Ifnar1P33896 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Ifnar1P33896 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Ifnar1P33896 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Ifnar1P33896 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29,01■■■□□ 2,23
Ifnar1P33896 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Ifnar1P33896 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2,23
Ifnar1P33896 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28,99■■■□□ 2,23
Ifnar1P33896 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,98■■■□□ 2,23
Ifnar1P33896 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28,97■■■□□ 2,23
Ifnar1P33896 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Ifnar1P33896 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28,93■■■□□ 2,22
Ifnar1P33896 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Ifnar1P33896 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28,9■■■□□ 2,22
Ifnar1P33896 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28,89■■■□□ 2,22
Ifnar1P33896 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Ifnar1P33896 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Ifnar1P33896 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Ifnar1P33896 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Ifnar1P33896 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Ifnar1P33896 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Ifnar1P33896 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28,83■■■□□ 2,21
Ifnar1P33896 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Ifnar1P33896 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28,82■■■□□ 2,2
Ifnar1P33896 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Ifnar1P33896 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28,8■■■□□ 2,2
Ifnar1P33896 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28,8■■■□□ 2,2
Ifnar1P33896 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Ifnar1P33896 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Ifnar1P33896 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Ifnar1P33896 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28,76■■■□□ 2,19
Ifnar1P33896 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Ifnar1P33896 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28,75■■■□□ 2,19
Ifnar1P33896 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28,75■■■□□ 2,19
Ifnar1P33896 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Ifnar1P33896 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Ifnar1P33896 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28,72■■■□□ 2,19
Ifnar1P33896 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Ifnar1P33896 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28,7■■■□□ 2,18
Ifnar1P33896 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
Ifnar1P33896 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
Ifnar1P33896 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Ifnar1P33896 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Ifnar1P33896 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28,69■■■□□ 2,18
Ifnar1P33896 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Ifnar1P33896 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Ifnar1P33896 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Ifnar1P33896 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Ifnar1P33896 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Ifnar1P33896 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Ifnar1P33896 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Ifnar1P33896 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28,59■■■□□ 2,17
Ifnar1P33896 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,59■■■□□ 2,17
Ifnar1P33896 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28,58■■■□□ 2,17
Ifnar1P33896 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,58■■■□□ 2,17
Ifnar1P33896 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28,56■■■□□ 2,16
Ifnar1P33896 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Ifnar1P33896 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Ifnar1P33896 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28,54■■■□□ 2,16
Ifnar1P33896 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Ifnar1P33896 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28,52■■■□□ 2,16
Ifnar1P33896 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Ifnar1P33896 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Ifnar1P33896 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28,49■■■□□ 2,15
Ifnar1P33896 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Ifnar1P33896 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,15
Ifnar1P33896 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Ifnar1P33896 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Ifnar1P33896 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28,43■■■□□ 2,14
Ifnar1P33896 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Ifnar1P33896 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Ifnar1P33896 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,13
Ifnar1P33896 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Ifnar1P33896 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Ifnar1P33896 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,34■■■□□ 2,13
Ifnar1P33896 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Ifnar1P33896 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Ifnar1P33896 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Ifnar1P33896 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,32■■■□□ 2,12
Ifnar1P33896 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Ifnar1P33896 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28,31■■■□□ 2,12
Ifnar1P33896 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Ifnar1P33896 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28,28■■■□□ 2,12
Ifnar1P33896 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Ifnar1P33896 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28,27■■■□□ 2,12
Ifnar1P33896 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Ifnar1P33896 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Ifnar1P33896 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28,25■■■□□ 2,11
Ifnar1P33896 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Ifnar1P33896 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28,25■■■□□ 2,11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21,8 ms