Protein–RNA interactions for Protein: P31955

Areg, Amphiregulin, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AregP31955 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AregP31955 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AregP31955 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AregP31955 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AregP31955 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AregP31955 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AregP31955 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AregP31955 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AregP31955 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AregP31955 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AregP31955 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AregP31955 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AregP31955 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AregP31955 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AregP31955 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AregP31955 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AregP31955 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AregP31955 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AregP31955 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AregP31955 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AregP31955 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AregP31955 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AregP31955 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AregP31955 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AregP31955 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AregP31955 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AregP31955 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AregP31955 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AregP31955 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AregP31955 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AregP31955 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AregP31955 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AregP31955 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
AregP31955 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AregP31955 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AregP31955 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AregP31955 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AregP31955 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AregP31955 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
AregP31955 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AregP31955 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AregP31955 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AregP31955 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AregP31955 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AregP31955 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AregP31955 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
AregP31955 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AregP31955 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AregP31955 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AregP31955 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AregP31955 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AregP31955 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AregP31955 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AregP31955 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AregP31955 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AregP31955 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AregP31955 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AregP31955 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AregP31955 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AregP31955 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AregP31955 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AregP31955 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AregP31955 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AregP31955 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AregP31955 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AregP31955 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AregP31955 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AregP31955 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AregP31955 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
AregP31955 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AregP31955 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AregP31955 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AregP31955 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
AregP31955 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AregP31955 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AregP31955 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AregP31955 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AregP31955 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AregP31955 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AregP31955 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AregP31955 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AregP31955 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AregP31955 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AregP31955 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AregP31955 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AregP31955 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AregP31955 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AregP31955 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AregP31955 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AregP31955 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AregP31955 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AregP31955 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
AregP31955 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AregP31955 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AregP31955 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AregP31955 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AregP31955 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AregP31955 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AregP31955 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AregP31955 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms