Protein–RNA interactions for Protein: P31311

Hoxa11, Homeobox protein Hox-A11, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa11P31311 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Hoxa11P31311 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Hoxa11P31311 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Hoxa11P31311 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Hoxa11P31311 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Hoxa11P31311 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Hoxa11P31311 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Hoxa11P31311 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Hoxa11P31311 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Hoxa11P31311 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Hoxa11P31311 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Hoxa11P31311 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Hoxa11P31311 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Hoxa11P31311 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Hoxa11P31311 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Hoxa11P31311 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Hoxa11P31311 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Hoxa11P31311 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Hoxa11P31311 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Hoxa11P31311 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Hoxa11P31311 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Hoxa11P31311 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Hoxa11P31311 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Hoxa11P31311 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Hoxa11P31311 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Hoxa11P31311 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Hoxa11P31311 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Hoxa11P31311 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Hoxa11P31311 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Hoxa11P31311 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Hoxa11P31311 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Hoxa11P31311 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Hoxa11P31311 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Hoxa11P31311 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Hoxa11P31311 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Hoxa11P31311 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Hoxa11P31311 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Hoxa11P31311 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Hoxa11P31311 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Hoxa11P31311 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Hoxa11P31311 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Hoxa11P31311 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Hoxa11P31311 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Hoxa11P31311 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Hoxa11P31311 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Hoxa11P31311 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Hoxa11P31311 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Hoxa11P31311 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Hoxa11P31311 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Hoxa11P31311 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Hoxa11P31311 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Hoxa11P31311 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Hoxa11P31311 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Hoxa11P31311 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Hoxa11P31311 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Hoxa11P31311 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Hoxa11P31311 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Hoxa11P31311 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Hoxa11P31311 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Hoxa11P31311 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Hoxa11P31311 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Hoxa11P31311 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Hoxa11P31311 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Hoxa11P31311 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Hoxa11P31311 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Hoxa11P31311 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Hoxa11P31311 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Hoxa11P31311 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Hoxa11P31311 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Hoxa11P31311 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Hoxa11P31311 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Hoxa11P31311 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Hoxa11P31311 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Hoxa11P31311 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Hoxa11P31311 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Hoxa11P31311 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Hoxa11P31311 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Hoxa11P31311 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Hoxa11P31311 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Hoxa11P31311 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Hoxa11P31311 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Hoxa11P31311 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Hoxa11P31311 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Hoxa11P31311 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Hoxa11P31311 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Hoxa11P31311 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Hoxa11P31311 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Hoxa11P31311 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Hoxa11P31311 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Hoxa11P31311 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Hoxa11P31311 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Hoxa11P31311 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Hoxa11P31311 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Hoxa11P31311 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Hoxa11P31311 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Hoxa11P31311 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Hoxa11P31311 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Hoxa11P31311 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Hoxa11P31311 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Hoxa11P31311 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms