Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cdk4P30285 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cdk4P30285 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cdk4P30285 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cdk4P30285 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cdk4P30285 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cdk4P30285 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cdk4P30285 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cdk4P30285 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cdk4P30285 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cdk4P30285 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cdk4P30285 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cdk4P30285 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cdk4P30285 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cdk4P30285 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cdk4P30285 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Cdk4P30285 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cdk4P30285 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cdk4P30285 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cdk4P30285 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cdk4P30285 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cdk4P30285 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cdk4P30285 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cdk4P30285 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cdk4P30285 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cdk4P30285 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cdk4P30285 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cdk4P30285 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cdk4P30285 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cdk4P30285 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cdk4P30285 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cdk4P30285 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cdk4P30285 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cdk4P30285 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cdk4P30285 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cdk4P30285 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cdk4P30285 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cdk4P30285 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cdk4P30285 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cdk4P30285 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cdk4P30285 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cdk4P30285 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cdk4P30285 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cdk4P30285 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cdk4P30285 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cdk4P30285 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cdk4P30285 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cdk4P30285 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Cdk4P30285 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cdk4P30285 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cdk4P30285 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cdk4P30285 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cdk4P30285 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cdk4P30285 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cdk4P30285 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cdk4P30285 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Cdk4P30285 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cdk4P30285 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cdk4P30285 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cdk4P30285 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cdk4P30285 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cdk4P30285 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cdk4P30285 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cdk4P30285 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdk4P30285 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cdk4P30285 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cdk4P30285 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdk4P30285 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cdk4P30285 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cdk4P30285 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdk4P30285 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cdk4P30285 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cdk4P30285 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdk4P30285 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Cdk4P30285 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cdk4P30285 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdk4P30285 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdk4P30285 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cdk4P30285 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cdk4P30285 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cdk4P30285 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cdk4P30285 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cdk4P30285 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cdk4P30285 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cdk4P30285 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cdk4P30285 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cdk4P30285 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cdk4P30285 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cdk4P30285 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cdk4P30285 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cdk4P30285 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cdk4P30285 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cdk4P30285 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cdk4P30285 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Cdk4P30285 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cdk4P30285 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cdk4P30285 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cdk4P30285 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cdk4P30285 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cdk4P30285 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms