Protein–RNA interactions for Protein: P29416

Hexa, Beta-hexosaminidase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HexaP29416 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HexaP29416 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HexaP29416 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HexaP29416 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HexaP29416 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HexaP29416 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HexaP29416 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HexaP29416 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HexaP29416 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HexaP29416 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HexaP29416 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HexaP29416 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HexaP29416 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HexaP29416 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HexaP29416 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HexaP29416 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HexaP29416 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HexaP29416 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HexaP29416 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HexaP29416 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HexaP29416 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HexaP29416 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HexaP29416 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HexaP29416 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HexaP29416 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HexaP29416 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HexaP29416 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HexaP29416 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HexaP29416 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HexaP29416 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HexaP29416 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HexaP29416 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HexaP29416 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HexaP29416 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HexaP29416 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HexaP29416 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HexaP29416 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HexaP29416 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HexaP29416 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HexaP29416 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HexaP29416 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HexaP29416 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HexaP29416 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HexaP29416 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HexaP29416 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HexaP29416 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HexaP29416 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HexaP29416 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HexaP29416 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HexaP29416 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HexaP29416 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HexaP29416 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HexaP29416 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HexaP29416 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HexaP29416 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HexaP29416 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HexaP29416 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HexaP29416 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HexaP29416 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HexaP29416 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HexaP29416 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HexaP29416 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HexaP29416 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HexaP29416 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HexaP29416 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HexaP29416 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HexaP29416 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HexaP29416 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HexaP29416 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HexaP29416 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HexaP29416 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HexaP29416 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HexaP29416 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HexaP29416 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HexaP29416 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HexaP29416 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HexaP29416 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HexaP29416 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HexaP29416 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HexaP29416 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HexaP29416 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HexaP29416 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HexaP29416 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HexaP29416 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HexaP29416 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HexaP29416 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HexaP29416 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HexaP29416 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HexaP29416 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HexaP29416 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HexaP29416 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HexaP29416 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HexaP29416 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HexaP29416 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HexaP29416 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HexaP29416 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HexaP29416 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HexaP29416 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HexaP29416 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HexaP29416 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms