Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RxrgP28705 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RxrgP28705 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RxrgP28705 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RxrgP28705 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RxrgP28705 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RxrgP28705 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RxrgP28705 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RxrgP28705 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RxrgP28705 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RxrgP28705 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RxrgP28705 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RxrgP28705 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RxrgP28705 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RxrgP28705 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RxrgP28705 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RxrgP28705 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RxrgP28705 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RxrgP28705 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RxrgP28705 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RxrgP28705 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RxrgP28705 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RxrgP28705 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RxrgP28705 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RxrgP28705 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RxrgP28705 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RxrgP28705 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RxrgP28705 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RxrgP28705 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RxrgP28705 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RxrgP28705 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RxrgP28705 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RxrgP28705 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RxrgP28705 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RxrgP28705 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RxrgP28705 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RxrgP28705 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RxrgP28705 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RxrgP28705 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RxrgP28705 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RxrgP28705 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RxrgP28705 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RxrgP28705 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RxrgP28705 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RxrgP28705 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RxrgP28705 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RxrgP28705 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RxrgP28705 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RxrgP28705 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RxrgP28705 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RxrgP28705 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RxrgP28705 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RxrgP28705 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RxrgP28705 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RxrgP28705 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RxrgP28705 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RxrgP28705 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RxrgP28705 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RxrgP28705 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RxrgP28705 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RxrgP28705 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RxrgP28705 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RxrgP28705 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RxrgP28705 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RxrgP28705 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RxrgP28705 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RxrgP28705 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RxrgP28705 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RxrgP28705 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RxrgP28705 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RxrgP28705 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RxrgP28705 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RxrgP28705 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RxrgP28705 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RxrgP28705 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RxrgP28705 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RxrgP28705 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RxrgP28705 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RxrgP28705 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RxrgP28705 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RxrgP28705 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RxrgP28705 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RxrgP28705 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RxrgP28705 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RxrgP28705 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RxrgP28705 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RxrgP28705 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RxrgP28705 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RxrgP28705 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RxrgP28705 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RxrgP28705 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RxrgP28705 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RxrgP28705 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RxrgP28705 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RxrgP28705 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RxrgP28705 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RxrgP28705 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RxrgP28705 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RxrgP28705 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RxrgP28705 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms