Protein–RNA interactions for Protein: P25911

Lyn, Tyrosine-protein kinase Lyn, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LynP25911 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LynP25911 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LynP25911 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LynP25911 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LynP25911 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LynP25911 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LynP25911 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LynP25911 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LynP25911 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LynP25911 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LynP25911 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LynP25911 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LynP25911 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LynP25911 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LynP25911 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LynP25911 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LynP25911 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LynP25911 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LynP25911 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LynP25911 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LynP25911 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LynP25911 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LynP25911 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LynP25911 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LynP25911 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LynP25911 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LynP25911 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LynP25911 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LynP25911 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LynP25911 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LynP25911 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LynP25911 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LynP25911 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LynP25911 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LynP25911 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LynP25911 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
LynP25911 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LynP25911 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LynP25911 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LynP25911 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LynP25911 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LynP25911 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LynP25911 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LynP25911 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LynP25911 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LynP25911 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LynP25911 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LynP25911 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LynP25911 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LynP25911 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LynP25911 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LynP25911 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LynP25911 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LynP25911 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LynP25911 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LynP25911 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LynP25911 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LynP25911 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LynP25911 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LynP25911 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LynP25911 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LynP25911 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LynP25911 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LynP25911 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LynP25911 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LynP25911 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LynP25911 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LynP25911 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LynP25911 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LynP25911 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LynP25911 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LynP25911 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LynP25911 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LynP25911 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LynP25911 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LynP25911 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LynP25911 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LynP25911 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LynP25911 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LynP25911 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LynP25911 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LynP25911 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LynP25911 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LynP25911 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LynP25911 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LynP25911 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LynP25911 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LynP25911 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LynP25911 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LynP25911 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LynP25911 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LynP25911 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LynP25911 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LynP25911 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LynP25911 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LynP25911 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LynP25911 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LynP25911 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LynP25911 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LynP25911 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms