Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NdnP25233 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NdnP25233 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NdnP25233 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NdnP25233 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NdnP25233 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NdnP25233 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NdnP25233 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NdnP25233 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NdnP25233 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NdnP25233 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NdnP25233 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NdnP25233 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NdnP25233 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NdnP25233 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NdnP25233 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NdnP25233 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NdnP25233 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NdnP25233 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NdnP25233 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NdnP25233 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NdnP25233 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NdnP25233 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NdnP25233 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NdnP25233 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NdnP25233 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NdnP25233 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NdnP25233 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NdnP25233 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NdnP25233 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NdnP25233 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NdnP25233 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NdnP25233 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NdnP25233 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NdnP25233 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NdnP25233 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NdnP25233 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NdnP25233 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NdnP25233 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NdnP25233 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NdnP25233 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NdnP25233 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NdnP25233 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NdnP25233 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NdnP25233 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NdnP25233 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NdnP25233 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NdnP25233 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NdnP25233 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NdnP25233 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NdnP25233 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NdnP25233 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NdnP25233 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NdnP25233 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NdnP25233 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NdnP25233 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NdnP25233 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NdnP25233 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NdnP25233 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NdnP25233 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NdnP25233 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NdnP25233 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NdnP25233 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NdnP25233 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NdnP25233 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NdnP25233 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NdnP25233 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NdnP25233 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NdnP25233 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NdnP25233 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NdnP25233 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NdnP25233 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NdnP25233 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NdnP25233 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NdnP25233 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NdnP25233 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NdnP25233 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NdnP25233 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NdnP25233 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NdnP25233 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NdnP25233 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NdnP25233 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NdnP25233 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NdnP25233 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NdnP25233 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NdnP25233 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NdnP25233 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NdnP25233 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NdnP25233 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NdnP25233 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NdnP25233 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NdnP25233 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NdnP25233 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NdnP25233 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NdnP25233 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NdnP25233 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NdnP25233 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NdnP25233 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NdnP25233 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NdnP25233 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms