Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ntf3P20181 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ntf3P20181 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ntf3P20181 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ntf3P20181 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ntf3P20181 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ntf3P20181 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ntf3P20181 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ntf3P20181 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ntf3P20181 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ntf3P20181 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ntf3P20181 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ntf3P20181 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ntf3P20181 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ntf3P20181 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ntf3P20181 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ntf3P20181 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ntf3P20181 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ntf3P20181 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ntf3P20181 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ntf3P20181 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ntf3P20181 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ntf3P20181 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ntf3P20181 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ntf3P20181 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ntf3P20181 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ntf3P20181 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ntf3P20181 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ntf3P20181 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ntf3P20181 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ntf3P20181 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ntf3P20181 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ntf3P20181 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ntf3P20181 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ntf3P20181 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ntf3P20181 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ntf3P20181 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ntf3P20181 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ntf3P20181 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ntf3P20181 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ntf3P20181 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ntf3P20181 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ntf3P20181 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ntf3P20181 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ntf3P20181 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ntf3P20181 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ntf3P20181 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ntf3P20181 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ntf3P20181 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ntf3P20181 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ntf3P20181 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ntf3P20181 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ntf3P20181 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ntf3P20181 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ntf3P20181 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ntf3P20181 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ntf3P20181 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ntf3P20181 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ntf3P20181 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ntf3P20181 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ntf3P20181 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ntf3P20181 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ntf3P20181 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ntf3P20181 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ntf3P20181 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ntf3P20181 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ntf3P20181 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ntf3P20181 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ntf3P20181 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ntf3P20181 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ntf3P20181 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ntf3P20181 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ntf3P20181 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ntf3P20181 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ntf3P20181 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ntf3P20181 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ntf3P20181 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ntf3P20181 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ntf3P20181 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ntf3P20181 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ntf3P20181 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ntf3P20181 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ntf3P20181 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ntf3P20181 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ntf3P20181 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ntf3P20181 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ntf3P20181 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ntf3P20181 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ntf3P20181 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ntf3P20181 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ntf3P20181 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ntf3P20181 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ntf3P20181 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ntf3P20181 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ntf3P20181 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ntf3P20181 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ntf3P20181 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ntf3P20181 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ntf3P20181 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ntf3P20181 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.4 ms