Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rps6ka3P18654 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rps6ka3P18654 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rps6ka3P18654 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rps6ka3P18654 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rps6ka3P18654 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rps6ka3P18654 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rps6ka3P18654 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rps6ka3P18654 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rps6ka3P18654 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Rps6ka3P18654 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rps6ka3P18654 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rps6ka3P18654 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rps6ka3P18654 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rps6ka3P18654 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rps6ka3P18654 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rps6ka3P18654 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rps6ka3P18654 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rps6ka3P18654 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rps6ka3P18654 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rps6ka3P18654 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rps6ka3P18654 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rps6ka3P18654 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Rps6ka3P18654 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rps6ka3P18654 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rps6ka3P18654 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rps6ka3P18654 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rps6ka3P18654 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rps6ka3P18654 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rps6ka3P18654 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rps6ka3P18654 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rps6ka3P18654 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rps6ka3P18654 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Rps6ka3P18654 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rps6ka3P18654 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rps6ka3P18654 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rps6ka3P18654 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rps6ka3P18654 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rps6ka3P18654 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rps6ka3P18654 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rps6ka3P18654 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rps6ka3P18654 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rps6ka3P18654 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rps6ka3P18654 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rps6ka3P18654 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rps6ka3P18654 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rps6ka3P18654 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rps6ka3P18654 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rps6ka3P18654 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rps6ka3P18654 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rps6ka3P18654 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rps6ka3P18654 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rps6ka3P18654 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rps6ka3P18654 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rps6ka3P18654 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rps6ka3P18654 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rps6ka3P18654 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rps6ka3P18654 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rps6ka3P18654 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rps6ka3P18654 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rps6ka3P18654 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rps6ka3P18654 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rps6ka3P18654 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rps6ka3P18654 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rps6ka3P18654 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rps6ka3P18654 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rps6ka3P18654 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rps6ka3P18654 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rps6ka3P18654 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rps6ka3P18654 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rps6ka3P18654 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rps6ka3P18654 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rps6ka3P18654 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rps6ka3P18654 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rps6ka3P18654 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rps6ka3P18654 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rps6ka3P18654 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rps6ka3P18654 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rps6ka3P18654 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Rps6ka3P18654 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rps6ka3P18654 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rps6ka3P18654 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rps6ka3P18654 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rps6ka3P18654 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rps6ka3P18654 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rps6ka3P18654 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rps6ka3P18654 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rps6ka3P18654 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rps6ka3P18654 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rps6ka3P18654 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rps6ka3P18654 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rps6ka3P18654 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rps6ka3P18654 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rps6ka3P18654 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rps6ka3P18654 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rps6ka3P18654 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rps6ka3P18654 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rps6ka3P18654 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rps6ka3P18654 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rps6ka3P18654 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms