Protein–RNA interactions for Protein: P16092

Fgfr1, Fibroblast growth factor receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr1P16092 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fgfr1P16092 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fgfr1P16092 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fgfr1P16092 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Fgfr1P16092 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fgfr1P16092 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fgfr1P16092 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fgfr1P16092 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fgfr1P16092 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fgfr1P16092 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fgfr1P16092 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fgfr1P16092 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fgfr1P16092 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fgfr1P16092 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fgfr1P16092 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Fgfr1P16092 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fgfr1P16092 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Fgfr1P16092 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fgfr1P16092 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fgfr1P16092 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fgfr1P16092 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fgfr1P16092 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fgfr1P16092 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fgfr1P16092 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fgfr1P16092 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fgfr1P16092 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Fgfr1P16092 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fgfr1P16092 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fgfr1P16092 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fgfr1P16092 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fgfr1P16092 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fgfr1P16092 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fgfr1P16092 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fgfr1P16092 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fgfr1P16092 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fgfr1P16092 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Fgfr1P16092 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Fgfr1P16092 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Fgfr1P16092 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Fgfr1P16092 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fgfr1P16092 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Fgfr1P16092 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Fgfr1P16092 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Fgfr1P16092 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Fgfr1P16092 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Fgfr1P16092 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Fgfr1P16092 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fgfr1P16092 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Fgfr1P16092 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fgfr1P16092 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fgfr1P16092 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Fgfr1P16092 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Fgfr1P16092 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Fgfr1P16092 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Fgfr1P16092 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Fgfr1P16092 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Fgfr1P16092 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Fgfr1P16092 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Fgfr1P16092 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Fgfr1P16092 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Fgfr1P16092 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fgfr1P16092 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Fgfr1P16092 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Fgfr1P16092 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Fgfr1P16092 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Fgfr1P16092 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Fgfr1P16092 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Fgfr1P16092 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Fgfr1P16092 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Fgfr1P16092 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fgfr1P16092 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fgfr1P16092 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fgfr1P16092 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fgfr1P16092 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fgfr1P16092 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fgfr1P16092 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fgfr1P16092 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fgfr1P16092 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fgfr1P16092 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fgfr1P16092 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Fgfr1P16092 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Fgfr1P16092 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Fgfr1P16092 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Fgfr1P16092 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Fgfr1P16092 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Fgfr1P16092 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fgfr1P16092 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fgfr1P16092 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fgfr1P16092 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fgfr1P16092 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fgfr1P16092 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fgfr1P16092 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fgfr1P16092 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Fgfr1P16092 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fgfr1P16092 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fgfr1P16092 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Fgfr1P16092 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Fgfr1P16092 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fgfr1P16092 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fgfr1P16092 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms