Protein–RNA interactions for Protein: P15508

Sptb, Spectrin beta chain, erythrocytic, mousemouse

Predictions only

Length 2,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptbP15508 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SptbP15508 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SptbP15508 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SptbP15508 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SptbP15508 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SptbP15508 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SptbP15508 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SptbP15508 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SptbP15508 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SptbP15508 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SptbP15508 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SptbP15508 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SptbP15508 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SptbP15508 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SptbP15508 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SptbP15508 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SptbP15508 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SptbP15508 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SptbP15508 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SptbP15508 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SptbP15508 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SptbP15508 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SptbP15508 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SptbP15508 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SptbP15508 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SptbP15508 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SptbP15508 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SptbP15508 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SptbP15508 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SptbP15508 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SptbP15508 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SptbP15508 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SptbP15508 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SptbP15508 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SptbP15508 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SptbP15508 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SptbP15508 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SptbP15508 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SptbP15508 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SptbP15508 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SptbP15508 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SptbP15508 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SptbP15508 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SptbP15508 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SptbP15508 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SptbP15508 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SptbP15508 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SptbP15508 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SptbP15508 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SptbP15508 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SptbP15508 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SptbP15508 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SptbP15508 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SptbP15508 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SptbP15508 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SptbP15508 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SptbP15508 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SptbP15508 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SptbP15508 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SptbP15508 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SptbP15508 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SptbP15508 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SptbP15508 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SptbP15508 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SptbP15508 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SptbP15508 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SptbP15508 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SptbP15508 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SptbP15508 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SptbP15508 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SptbP15508 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SptbP15508 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SptbP15508 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SptbP15508 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SptbP15508 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SptbP15508 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SptbP15508 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SptbP15508 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SptbP15508 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SptbP15508 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SptbP15508 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SptbP15508 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SptbP15508 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SptbP15508 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SptbP15508 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SptbP15508 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SptbP15508 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SptbP15508 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SptbP15508 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SptbP15508 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SptbP15508 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SptbP15508 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SptbP15508 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SptbP15508 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SptbP15508 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SptbP15508 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SptbP15508 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SptbP15508 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SptbP15508 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SptbP15508 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms