Protein–RNA interactions for Protein: P13405

Rb1, Retinoblastoma-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1P13405 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Rb1P13405 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rb1P13405 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rb1P13405 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rb1P13405 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rb1P13405 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rb1P13405 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rb1P13405 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rb1P13405 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rb1P13405 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rb1P13405 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Rb1P13405 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rb1P13405 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rb1P13405 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rb1P13405 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rb1P13405 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rb1P13405 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rb1P13405 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Rb1P13405 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rb1P13405 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rb1P13405 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rb1P13405 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rb1P13405 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rb1P13405 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rb1P13405 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rb1P13405 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Rb1P13405 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rb1P13405 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rb1P13405 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rb1P13405 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rb1P13405 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rb1P13405 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rb1P13405 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rb1P13405 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rb1P13405 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rb1P13405 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rb1P13405 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rb1P13405 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rb1P13405 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rb1P13405 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rb1P13405 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rb1P13405 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rb1P13405 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Rb1P13405 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rb1P13405 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rb1P13405 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rb1P13405 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Rb1P13405 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rb1P13405 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rb1P13405 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rb1P13405 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rb1P13405 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rb1P13405 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rb1P13405 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rb1P13405 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rb1P13405 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rb1P13405 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rb1P13405 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Rb1P13405 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rb1P13405 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rb1P13405 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rb1P13405 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rb1P13405 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rb1P13405 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rb1P13405 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rb1P13405 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rb1P13405 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rb1P13405 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rb1P13405 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rb1P13405 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rb1P13405 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Rb1P13405 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rb1P13405 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rb1P13405 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rb1P13405 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rb1P13405 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rb1P13405 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rb1P13405 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rb1P13405 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rb1P13405 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rb1P13405 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rb1P13405 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rb1P13405 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rb1P13405 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rb1P13405 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rb1P13405 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rb1P13405 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rb1P13405 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rb1P13405 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rb1P13405 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rb1P13405 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rb1P13405 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rb1P13405 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rb1P13405 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rb1P13405 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rb1P13405 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rb1P13405 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rb1P13405 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rb1P13405 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rb1P13405 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms