Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hoxa9P09631 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hoxa9P09631 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hoxa9P09631 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hoxa9P09631 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hoxa9P09631 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hoxa9P09631 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Hoxa9P09631 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hoxa9P09631 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hoxa9P09631 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Hoxa9P09631 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hoxa9P09631 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hoxa9P09631 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hoxa9P09631 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Hoxa9P09631 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hoxa9P09631 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hoxa9P09631 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hoxa9P09631 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hoxa9P09631 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hoxa9P09631 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hoxa9P09631 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hoxa9P09631 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hoxa9P09631 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hoxa9P09631 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hoxa9P09631 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hoxa9P09631 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hoxa9P09631 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Hoxa9P09631 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hoxa9P09631 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hoxa9P09631 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hoxa9P09631 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hoxa9P09631 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hoxa9P09631 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hoxa9P09631 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hoxa9P09631 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hoxa9P09631 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hoxa9P09631 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Hoxa9P09631 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hoxa9P09631 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hoxa9P09631 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hoxa9P09631 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hoxa9P09631 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hoxa9P09631 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hoxa9P09631 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hoxa9P09631 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hoxa9P09631 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Hoxa9P09631 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hoxa9P09631 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hoxa9P09631 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hoxa9P09631 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hoxa9P09631 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hoxa9P09631 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hoxa9P09631 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hoxa9P09631 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hoxa9P09631 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hoxa9P09631 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hoxa9P09631 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hoxa9P09631 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hoxa9P09631 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Hoxa9P09631 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hoxa9P09631 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hoxa9P09631 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Hoxa9P09631 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hoxa9P09631 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hoxa9P09631 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hoxa9P09631 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hoxa9P09631 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hoxa9P09631 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hoxa9P09631 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hoxa9P09631 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hoxa9P09631 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hoxa9P09631 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hoxa9P09631 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hoxa9P09631 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hoxa9P09631 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hoxa9P09631 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hoxa9P09631 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hoxa9P09631 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hoxa9P09631 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hoxa9P09631 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hoxa9P09631 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hoxa9P09631 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hoxa9P09631 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hoxa9P09631 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hoxa9P09631 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hoxa9P09631 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hoxa9P09631 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hoxa9P09631 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hoxa9P09631 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hoxa9P09631 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hoxa9P09631 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hoxa9P09631 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hoxa9P09631 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hoxa9P09631 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hoxa9P09631 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hoxa9P09631 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hoxa9P09631 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hoxa9P09631 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Hoxa9P09631 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hoxa9P09631 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms