Protein–RNA interactions for Protein: P08003

Pdia4, Protein disulfide-isomerase A4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdia4P08003 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pdia4P08003 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Pdia4P08003 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Pdia4P08003 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pdia4P08003 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pdia4P08003 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pdia4P08003 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pdia4P08003 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Pdia4P08003 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pdia4P08003 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pdia4P08003 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pdia4P08003 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pdia4P08003 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pdia4P08003 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pdia4P08003 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pdia4P08003 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pdia4P08003 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pdia4P08003 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pdia4P08003 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pdia4P08003 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pdia4P08003 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pdia4P08003 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pdia4P08003 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Pdia4P08003 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pdia4P08003 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pdia4P08003 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pdia4P08003 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pdia4P08003 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pdia4P08003 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pdia4P08003 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pdia4P08003 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pdia4P08003 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pdia4P08003 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pdia4P08003 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Pdia4P08003 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pdia4P08003 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Pdia4P08003 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pdia4P08003 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pdia4P08003 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pdia4P08003 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pdia4P08003 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pdia4P08003 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Pdia4P08003 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pdia4P08003 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pdia4P08003 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pdia4P08003 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pdia4P08003 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pdia4P08003 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Pdia4P08003 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pdia4P08003 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pdia4P08003 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pdia4P08003 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pdia4P08003 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pdia4P08003 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pdia4P08003 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pdia4P08003 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pdia4P08003 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pdia4P08003 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pdia4P08003 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pdia4P08003 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pdia4P08003 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pdia4P08003 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pdia4P08003 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pdia4P08003 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Pdia4P08003 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pdia4P08003 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pdia4P08003 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pdia4P08003 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pdia4P08003 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pdia4P08003 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Pdia4P08003 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Pdia4P08003 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Pdia4P08003 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pdia4P08003 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pdia4P08003 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pdia4P08003 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pdia4P08003 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pdia4P08003 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pdia4P08003 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pdia4P08003 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pdia4P08003 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pdia4P08003 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pdia4P08003 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pdia4P08003 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pdia4P08003 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pdia4P08003 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pdia4P08003 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pdia4P08003 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pdia4P08003 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pdia4P08003 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pdia4P08003 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pdia4P08003 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pdia4P08003 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pdia4P08003 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pdia4P08003 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pdia4P08003 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pdia4P08003 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pdia4P08003 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Pdia4P08003 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pdia4P08003 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms