Protein–RNA interactions for Protein: P07349

Ifna5, Interferon alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna5P07349 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ifna5P07349 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ifna5P07349 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Ifna5P07349 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ifna5P07349 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ifna5P07349 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ifna5P07349 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ifna5P07349 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ifna5P07349 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ifna5P07349 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ifna5P07349 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ifna5P07349 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ifna5P07349 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ifna5P07349 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ifna5P07349 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ifna5P07349 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ifna5P07349 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ifna5P07349 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ifna5P07349 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ifna5P07349 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ifna5P07349 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ifna5P07349 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ifna5P07349 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ifna5P07349 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ifna5P07349 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ifna5P07349 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ifna5P07349 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ifna5P07349 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ifna5P07349 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ifna5P07349 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ifna5P07349 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ifna5P07349 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ifna5P07349 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ifna5P07349 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ifna5P07349 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ifna5P07349 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ifna5P07349 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifna5P07349 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifna5P07349 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifna5P07349 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifna5P07349 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifna5P07349 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ifna5P07349 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ifna5P07349 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifna5P07349 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ifna5P07349 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ifna5P07349 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ifna5P07349 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ifna5P07349 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ifna5P07349 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ifna5P07349 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ifna5P07349 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ifna5P07349 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ifna5P07349 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ifna5P07349 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ifna5P07349 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ifna5P07349 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ifna5P07349 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ifna5P07349 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ifna5P07349 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ifna5P07349 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ifna5P07349 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ifna5P07349 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ifna5P07349 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ifna5P07349 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ifna5P07349 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ifna5P07349 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ifna5P07349 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ifna5P07349 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ifna5P07349 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ifna5P07349 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ifna5P07349 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ifna5P07349 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ifna5P07349 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ifna5P07349 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ifna5P07349 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ifna5P07349 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ifna5P07349 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ifna5P07349 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ifna5P07349 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ifna5P07349 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ifna5P07349 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ifna5P07349 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ifna5P07349 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ifna5P07349 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ifna5P07349 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ifna5P07349 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ifna5P07349 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ifna5P07349 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifna5P07349 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifna5P07349 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ifna5P07349 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifna5P07349 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifna5P07349 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifna5P07349 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifna5P07349 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifna5P07349 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifna5P07349 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifna5P07349 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifna5P07349 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms