Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-Ab1P01921 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-Ab1P01921 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-Ab1P01921 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-Ab1P01921 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-Ab1P01921 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2-Ab1P01921 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2-Ab1P01921 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2-Ab1P01921 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2-Ab1P01921 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2-Ab1P01921 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2-Ab1P01921 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2-Ab1P01921 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-Ab1P01921 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2-Ab1P01921 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2-Ab1P01921 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2-Ab1P01921 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2-Ab1P01921 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2-Ab1P01921 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2-Ab1P01921 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2-Ab1P01921 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2-Ab1P01921 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2-Ab1P01921 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2-Ab1P01921 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2-Ab1P01921 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2-Ab1P01921 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2-Ab1P01921 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2-Ab1P01921 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2-Ab1P01921 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2-Ab1P01921 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2-Ab1P01921 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2-Ab1P01921 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2-Ab1P01921 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
H2-Ab1P01921 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2-Ab1P01921 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2-Ab1P01921 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2-Ab1P01921 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2-Ab1P01921 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2-Ab1P01921 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
H2-Ab1P01921 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
H2-Ab1P01921 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
H2-Ab1P01921 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
H2-Ab1P01921 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
H2-Ab1P01921 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
H2-Ab1P01921 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2-Ab1P01921 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2-Ab1P01921 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2-Ab1P01921 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-Ab1P01921 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-Ab1P01921 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-Ab1P01921 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-Ab1P01921 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-Ab1P01921 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-Ab1P01921 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-Ab1P01921 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-Ab1P01921 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-Ab1P01921 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-Ab1P01921 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-Ab1P01921 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-Ab1P01921 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-Ab1P01921 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2-Ab1P01921 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-Ab1P01921 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-Ab1P01921 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-Ab1P01921 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-Ab1P01921 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-Ab1P01921 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-Ab1P01921 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-Ab1P01921 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-Ab1P01921 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-Ab1P01921 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-Ab1P01921 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-Ab1P01921 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2-Ab1P01921 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-Ab1P01921 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-Ab1P01921 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-Ab1P01921 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-Ab1P01921 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-Ab1P01921 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-Ab1P01921 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-Ab1P01921 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-Ab1P01921 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-Ab1P01921 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-Ab1P01921 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2-Ab1P01921 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2-Ab1P01921 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2-Ab1P01921 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2-Ab1P01921 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-Ab1P01921 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2-Ab1P01921 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2-Ab1P01921 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-Ab1P01921 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-Ab1P01921 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-Ab1P01921 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-Ab1P01921 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-Ab1P01921 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-Ab1P01921 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-Ab1P01921 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-Ab1P01921 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-Ab1P01921 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms