Protein–RNA interactions for Protein: P00405

Mtco2, Cytochrome c oxidase subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtco2P00405 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Mtco2P00405 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Mtco2P00405 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
Mtco2P00405 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
Mtco2P00405 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20,44■□□□□ 0,86
Mtco2P00405 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20,44■□□□□ 0,86
Mtco2P00405 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
Mtco2P00405 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC20,44■□□□□ 0,86
Mtco2P00405 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
Mtco2P00405 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
Mtco2P00405 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
Mtco2P00405 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Mtco2P00405 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,41■□□□□ 0,86
Mtco2P00405 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,4■□□□□ 0,86
Mtco2P00405 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,4■□□□□ 0,86
Mtco2P00405 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,39■□□□□ 0,85
Mtco2P00405 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,38■□□□□ 0,85
Mtco2P00405 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,38■□□□□ 0,85
Mtco2P00405 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,38■□□□□ 0,85
Mtco2P00405 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
Mtco2P00405 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20,37■□□□□ 0,85
Mtco2P00405 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20,37■□□□□ 0,85
Mtco2P00405 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
Mtco2P00405 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20,36■□□□□ 0,85
Mtco2P00405 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,35■□□□□ 0,85
Mtco2P00405 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,35■□□□□ 0,85
Mtco2P00405 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,35■□□□□ 0,85
Mtco2P00405 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,34■□□□□ 0,85
Mtco2P00405 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20,33■□□□□ 0,85
Mtco2P00405 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,32■□□□□ 0,84
Mtco2P00405 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,32■□□□□ 0,84
Mtco2P00405 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,31■□□□□ 0,84
Mtco2P00405 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,3■□□□□ 0,84
Mtco2P00405 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,3■□□□□ 0,84
Mtco2P00405 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,29■□□□□ 0,84
Mtco2P00405 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,28■□□□□ 0,84
Mtco2P00405 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,27■□□□□ 0,84
Mtco2P00405 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20,26■□□□□ 0,83
Mtco2P00405 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20,26■□□□□ 0,83
Mtco2P00405 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,26■□□□□ 0,83
Mtco2P00405 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,24■□□□□ 0,83
Mtco2P00405 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,23■□□□□ 0,83
Mtco2P00405 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20,23■□□□□ 0,83
Mtco2P00405 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,23■□□□□ 0,83
Mtco2P00405 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,23■□□□□ 0,83
Mtco2P00405 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20,22■□□□□ 0,83
Mtco2P00405 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,21■□□□□ 0,83
Mtco2P00405 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,21■□□□□ 0,83
Mtco2P00405 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20,21■□□□□ 0,83
Mtco2P00405 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20,2■□□□□ 0,82
Mtco2P00405 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,2■□□□□ 0,82
Mtco2P00405 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,2■□□□□ 0,82
Mtco2P00405 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,19■□□□□ 0,82
Mtco2P00405 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,19■□□□□ 0,82
Mtco2P00405 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,19■□□□□ 0,82
Mtco2P00405 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,19■□□□□ 0,82
Mtco2P00405 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20,19■□□□□ 0,82
Mtco2P00405 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20,18■□□□□ 0,82
Mtco2P00405 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20,17■□□□□ 0,82
Mtco2P00405 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20,15■□□□□ 0,82
Mtco2P00405 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,14■□□□□ 0,81
Mtco2P00405 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,13■□□□□ 0,81
Mtco2P00405 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,13■□□□□ 0,81
Mtco2P00405 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,13■□□□□ 0,81
Mtco2P00405 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,12■□□□□ 0,81
Mtco2P00405 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,11■□□□□ 0,81
Mtco2P00405 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20,11■□□□□ 0,81
Mtco2P00405 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,1■□□□□ 0,81
Mtco2P00405 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,1■□□□□ 0,81
Mtco2P00405 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,1■□□□□ 0,81
Mtco2P00405 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20,1■□□□□ 0,81
Mtco2P00405 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,1■□□□□ 0,81
Mtco2P00405 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,09■□□□□ 0,81
Mtco2P00405 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,09■□□□□ 0,81
Mtco2P00405 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,08■□□□□ 0,81
Mtco2P00405 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,07■□□□□ 0,8
Mtco2P00405 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,07■□□□□ 0,8
Mtco2P00405 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,06■□□□□ 0,8
Mtco2P00405 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,06■□□□□ 0,8
Mtco2P00405 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,06■□□□□ 0,8
Mtco2P00405 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20,05■□□□□ 0,8
Mtco2P00405 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20,04■□□□□ 0,8
Mtco2P00405 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,04■□□□□ 0,8
Mtco2P00405 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,04■□□□□ 0,8
Mtco2P00405 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,04■□□□□ 0,8
Mtco2P00405 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,02■□□□□ 0,8
Mtco2P00405 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,01■□□□□ 0,79
Mtco2P00405 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,01■□□□□ 0,79
Mtco2P00405 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0,79
Mtco2P00405 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0,79
Mtco2P00405 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19,98■□□□□ 0,79
Mtco2P00405 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19,98■□□□□ 0,79
Mtco2P00405 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19,98■□□□□ 0,79
Mtco2P00405 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,97■□□□□ 0,79
Mtco2P00405 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,96■□□□□ 0,79
Mtco2P00405 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19,95■□□□□ 0,78
Mtco2P00405 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,95■□□□□ 0,78
Mtco2P00405 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,94■□□□□ 0,78
Mtco2P00405 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19,94■□□□□ 0,78
Mtco2P00405 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,93■□□□□ 0,78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29,1 ms