Protein–RNA interactions for Protein: O89116

Vti1a, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1aO89116 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Vti1aO89116 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Vti1aO89116 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Vti1aO89116 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Vti1aO89116 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Vti1aO89116 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Vti1aO89116 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Vti1aO89116 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Vti1aO89116 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Vti1aO89116 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Vti1aO89116 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Vti1aO89116 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Vti1aO89116 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Vti1aO89116 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Vti1aO89116 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Vti1aO89116 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Vti1aO89116 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Vti1aO89116 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Vti1aO89116 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Vti1aO89116 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Vti1aO89116 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Vti1aO89116 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Vti1aO89116 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Vti1aO89116 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Vti1aO89116 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Vti1aO89116 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Vti1aO89116 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Vti1aO89116 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Vti1aO89116 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Vti1aO89116 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Vti1aO89116 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Vti1aO89116 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Vti1aO89116 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Vti1aO89116 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Vti1aO89116 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Vti1aO89116 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Vti1aO89116 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Vti1aO89116 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Vti1aO89116 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Vti1aO89116 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Vti1aO89116 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Vti1aO89116 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Vti1aO89116 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Vti1aO89116 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Vti1aO89116 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Vti1aO89116 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Vti1aO89116 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Vti1aO89116 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Vti1aO89116 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Vti1aO89116 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Vti1aO89116 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Vti1aO89116 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Vti1aO89116 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Vti1aO89116 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Vti1aO89116 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Vti1aO89116 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Vti1aO89116 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Vti1aO89116 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Vti1aO89116 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Vti1aO89116 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Vti1aO89116 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Vti1aO89116 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Vti1aO89116 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Vti1aO89116 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Vti1aO89116 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Vti1aO89116 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Vti1aO89116 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vti1aO89116 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Vti1aO89116 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Vti1aO89116 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Vti1aO89116 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Vti1aO89116 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Vti1aO89116 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Vti1aO89116 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Vti1aO89116 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Vti1aO89116 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Vti1aO89116 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Vti1aO89116 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Vti1aO89116 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Vti1aO89116 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Vti1aO89116 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Vti1aO89116 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Vti1aO89116 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Vti1aO89116 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Vti1aO89116 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Vti1aO89116 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Vti1aO89116 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vti1aO89116 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vti1aO89116 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vti1aO89116 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Vti1aO89116 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Vti1aO89116 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Vti1aO89116 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Vti1aO89116 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Vti1aO89116 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Vti1aO89116 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Vti1aO89116 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Vti1aO89116 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Vti1aO89116 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Vti1aO89116 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms