Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Tnnt1O88346 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Tnnt1O88346 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Tnnt1O88346 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Tnnt1O88346 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Tnnt1O88346 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Tnnt1O88346 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Tnnt1O88346 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Tnnt1O88346 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Tnnt1O88346 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Tnnt1O88346 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Tnnt1O88346 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
Tnnt1O88346 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Tnnt1O88346 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Tnnt1O88346 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Tnnt1O88346 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Tnnt1O88346 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Tnnt1O88346 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Tnnt1O88346 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Tnnt1O88346 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Tnnt1O88346 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Tnnt1O88346 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Tnnt1O88346 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Tnnt1O88346 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Tnnt1O88346 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Tnnt1O88346 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Tnnt1O88346 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Tnnt1O88346 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Tnnt1O88346 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Tnnt1O88346 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Tnnt1O88346 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Tnnt1O88346 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Tnnt1O88346 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Tnnt1O88346 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Tnnt1O88346 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Tnnt1O88346 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Tnnt1O88346 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Tnnt1O88346 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Tnnt1O88346 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Tnnt1O88346 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Tnnt1O88346 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Tnnt1O88346 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Tnnt1O88346 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Tnnt1O88346 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
Tnnt1O88346 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Tnnt1O88346 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.93
Tnnt1O88346 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Tnnt1O88346 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Tnnt1O88346 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Tnnt1O88346 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Tnnt1O88346 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Tnnt1O88346 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Tnnt1O88346 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Tnnt1O88346 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Tnnt1O88346 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Tnnt1O88346 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Tnnt1O88346 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Tnnt1O88346 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Tnnt1O88346 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Tnnt1O88346 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Tnnt1O88346 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Tnnt1O88346 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Tnnt1O88346 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Tnnt1O88346 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Tnnt1O88346 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Tnnt1O88346 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Tnnt1O88346 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Tnnt1O88346 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Tnnt1O88346 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Tnnt1O88346 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Tnnt1O88346 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Tnnt1O88346 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Tnnt1O88346 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Tnnt1O88346 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Tnnt1O88346 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Tnnt1O88346 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Tnnt1O88346 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Tnnt1O88346 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC32.95■■■□□ 2.86
Tnnt1O88346 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Tnnt1O88346 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Tnnt1O88346 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Tnnt1O88346 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Tnnt1O88346 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Tnnt1O88346 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Tnnt1O88346 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Tnnt1O88346 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Tnnt1O88346 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Tnnt1O88346 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Tnnt1O88346 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Tnnt1O88346 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Tnnt1O88346 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Tnnt1O88346 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Tnnt1O88346 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
Tnnt1O88346 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Tnnt1O88346 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Tnnt1O88346 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Tnnt1O88346 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Tnnt1O88346 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Tnnt1O88346 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Tnnt1O88346 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms