Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col5a1O88207 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col5a1O88207 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col5a1O88207 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col5a1O88207 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col5a1O88207 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col5a1O88207 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col5a1O88207 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col5a1O88207 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col5a1O88207 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col5a1O88207 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col5a1O88207 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Col5a1O88207 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col5a1O88207 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col5a1O88207 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col5a1O88207 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col5a1O88207 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col5a1O88207 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Col5a1O88207 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col5a1O88207 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Col5a1O88207 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col5a1O88207 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col5a1O88207 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col5a1O88207 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col5a1O88207 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Col5a1O88207 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col5a1O88207 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col5a1O88207 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col5a1O88207 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col5a1O88207 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col5a1O88207 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Col5a1O88207 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col5a1O88207 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col5a1O88207 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Col5a1O88207 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col5a1O88207 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Col5a1O88207 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Col5a1O88207 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col5a1O88207 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col5a1O88207 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col5a1O88207 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col5a1O88207 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col5a1O88207 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col5a1O88207 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col5a1O88207 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Col5a1O88207 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col5a1O88207 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col5a1O88207 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col5a1O88207 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col5a1O88207 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col5a1O88207 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col5a1O88207 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col5a1O88207 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col5a1O88207 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col5a1O88207 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col5a1O88207 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col5a1O88207 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col5a1O88207 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col5a1O88207 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col5a1O88207 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col5a1O88207 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col5a1O88207 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col5a1O88207 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col5a1O88207 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col5a1O88207 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col5a1O88207 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col5a1O88207 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col5a1O88207 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col5a1O88207 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col5a1O88207 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col5a1O88207 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col5a1O88207 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col5a1O88207 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col5a1O88207 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col5a1O88207 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col5a1O88207 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col5a1O88207 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col5a1O88207 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col5a1O88207 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Col5a1O88207 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col5a1O88207 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col5a1O88207 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col5a1O88207 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Col5a1O88207 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col5a1O88207 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col5a1O88207 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col5a1O88207 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col5a1O88207 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col5a1O88207 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col5a1O88207 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col5a1O88207 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col5a1O88207 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col5a1O88207 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col5a1O88207 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col5a1O88207 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col5a1O88207 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col5a1O88207 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col5a1O88207 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col5a1O88207 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Col5a1O88207 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms