Protein–RNA interactions for Protein: O70493

Snx12, Sorting nexin-12, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx12O70493 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Snx12O70493 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Snx12O70493 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Snx12O70493 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Snx12O70493 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Snx12O70493 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Snx12O70493 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Snx12O70493 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Snx12O70493 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Snx12O70493 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Snx12O70493 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Snx12O70493 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Snx12O70493 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Snx12O70493 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Snx12O70493 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Snx12O70493 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Snx12O70493 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Snx12O70493 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Snx12O70493 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Snx12O70493 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Snx12O70493 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Snx12O70493 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Snx12O70493 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Snx12O70493 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Snx12O70493 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Snx12O70493 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Snx12O70493 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Snx12O70493 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Snx12O70493 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Snx12O70493 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Snx12O70493 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Snx12O70493 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Snx12O70493 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Snx12O70493 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Snx12O70493 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Snx12O70493 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Snx12O70493 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Snx12O70493 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Snx12O70493 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Snx12O70493 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Snx12O70493 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Snx12O70493 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Snx12O70493 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Snx12O70493 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Snx12O70493 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Snx12O70493 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Snx12O70493 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Snx12O70493 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Snx12O70493 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Snx12O70493 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Snx12O70493 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Snx12O70493 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Snx12O70493 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Snx12O70493 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Snx12O70493 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Snx12O70493 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Snx12O70493 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Snx12O70493 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Snx12O70493 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Snx12O70493 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Snx12O70493 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Snx12O70493 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Snx12O70493 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Snx12O70493 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Snx12O70493 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Snx12O70493 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Snx12O70493 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Snx12O70493 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Snx12O70493 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Snx12O70493 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Snx12O70493 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Snx12O70493 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Snx12O70493 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Snx12O70493 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Snx12O70493 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Snx12O70493 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Snx12O70493 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Snx12O70493 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Snx12O70493 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Snx12O70493 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Snx12O70493 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Snx12O70493 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Snx12O70493 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Snx12O70493 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Snx12O70493 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Snx12O70493 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Snx12O70493 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Snx12O70493 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Snx12O70493 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Snx12O70493 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Snx12O70493 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Snx12O70493 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Snx12O70493 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Snx12O70493 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Snx12O70493 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Snx12O70493 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Snx12O70493 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Snx12O70493 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Snx12O70493 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Snx12O70493 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms