Protein–RNA interactions for Protein: O70191

Atf5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf5O70191 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Atf5O70191 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Atf5O70191 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Atf5O70191 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Atf5O70191 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Atf5O70191 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Atf5O70191 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Atf5O70191 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Atf5O70191 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Atf5O70191 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Atf5O70191 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Atf5O70191 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Atf5O70191 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Atf5O70191 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Atf5O70191 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Atf5O70191 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Atf5O70191 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Atf5O70191 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Atf5O70191 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Atf5O70191 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Atf5O70191 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Atf5O70191 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Atf5O70191 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Atf5O70191 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Atf5O70191 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Atf5O70191 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Atf5O70191 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Atf5O70191 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Atf5O70191 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Atf5O70191 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Atf5O70191 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Atf5O70191 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Atf5O70191 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Atf5O70191 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Atf5O70191 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
Atf5O70191 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Atf5O70191 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Atf5O70191 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Atf5O70191 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Atf5O70191 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Atf5O70191 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Atf5O70191 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Atf5O70191 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Atf5O70191 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Atf5O70191 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Atf5O70191 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Atf5O70191 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Atf5O70191 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Atf5O70191 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Atf5O70191 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Atf5O70191 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Atf5O70191 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Atf5O70191 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Atf5O70191 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Atf5O70191 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Atf5O70191 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Atf5O70191 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Atf5O70191 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Atf5O70191 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Atf5O70191 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Atf5O70191 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Atf5O70191 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Atf5O70191 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Atf5O70191 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Atf5O70191 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Atf5O70191 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Atf5O70191 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Atf5O70191 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Atf5O70191 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Atf5O70191 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Atf5O70191 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Atf5O70191 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Atf5O70191 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Atf5O70191 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Atf5O70191 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Atf5O70191 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Atf5O70191 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Atf5O70191 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Atf5O70191 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Atf5O70191 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Atf5O70191 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Atf5O70191 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Atf5O70191 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Atf5O70191 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Atf5O70191 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Atf5O70191 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Atf5O70191 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Atf5O70191 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
Atf5O70191 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Atf5O70191 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Atf5O70191 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Atf5O70191 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Atf5O70191 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Atf5O70191 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Atf5O70191 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Atf5O70191 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Atf5O70191 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Atf5O70191 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Atf5O70191 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Atf5O70191 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156.2 ms