Protein–RNA interactions for Protein: O55112

Aff2, AF4/FMR2 family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff2O55112 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Aff2O55112 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Aff2O55112 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Aff2O55112 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Aff2O55112 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Aff2O55112 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Aff2O55112 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Aff2O55112 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Aff2O55112 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Aff2O55112 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Aff2O55112 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Aff2O55112 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Aff2O55112 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Aff2O55112 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Aff2O55112 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Aff2O55112 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Aff2O55112 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Aff2O55112 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Aff2O55112 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Aff2O55112 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Aff2O55112 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Aff2O55112 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Aff2O55112 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Aff2O55112 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Aff2O55112 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Aff2O55112 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Aff2O55112 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Aff2O55112 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Aff2O55112 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Aff2O55112 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Aff2O55112 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Aff2O55112 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Aff2O55112 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Aff2O55112 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Aff2O55112 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Aff2O55112 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Aff2O55112 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Aff2O55112 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Aff2O55112 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Aff2O55112 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Aff2O55112 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Aff2O55112 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Aff2O55112 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Aff2O55112 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Aff2O55112 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Aff2O55112 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Aff2O55112 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Aff2O55112 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Aff2O55112 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Aff2O55112 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Aff2O55112 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Aff2O55112 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Aff2O55112 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Aff2O55112 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Aff2O55112 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Aff2O55112 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Aff2O55112 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Aff2O55112 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Aff2O55112 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Aff2O55112 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Aff2O55112 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Aff2O55112 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Aff2O55112 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Aff2O55112 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Aff2O55112 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Aff2O55112 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Aff2O55112 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Aff2O55112 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Aff2O55112 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Aff2O55112 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Aff2O55112 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Aff2O55112 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Aff2O55112 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Aff2O55112 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Aff2O55112 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Aff2O55112 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Aff2O55112 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Aff2O55112 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Aff2O55112 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Aff2O55112 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Aff2O55112 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Aff2O55112 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Aff2O55112 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Aff2O55112 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Aff2O55112 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Aff2O55112 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Aff2O55112 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Aff2O55112 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Aff2O55112 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Aff2O55112 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Aff2O55112 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Aff2O55112 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Aff2O55112 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Aff2O55112 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Aff2O55112 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Aff2O55112 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Aff2O55112 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Aff2O55112 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Aff2O55112 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Aff2O55112 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms