Protein–RNA interactions for Protein: O55106

Strn, Striatin, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StrnO55106 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
StrnO55106 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
StrnO55106 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
StrnO55106 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
StrnO55106 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
StrnO55106 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
StrnO55106 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
StrnO55106 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
StrnO55106 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
StrnO55106 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
StrnO55106 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
StrnO55106 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
StrnO55106 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
StrnO55106 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
StrnO55106 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
StrnO55106 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
StrnO55106 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
StrnO55106 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
StrnO55106 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
StrnO55106 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
StrnO55106 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
StrnO55106 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
StrnO55106 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
StrnO55106 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
StrnO55106 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
StrnO55106 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
StrnO55106 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
StrnO55106 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
StrnO55106 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
StrnO55106 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
StrnO55106 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
StrnO55106 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
StrnO55106 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
StrnO55106 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
StrnO55106 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
StrnO55106 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
StrnO55106 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
StrnO55106 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
StrnO55106 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29■■■□□ 2.23
StrnO55106 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
StrnO55106 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
StrnO55106 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
StrnO55106 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
StrnO55106 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
StrnO55106 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
StrnO55106 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
StrnO55106 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
StrnO55106 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
StrnO55106 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
StrnO55106 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
StrnO55106 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
StrnO55106 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
StrnO55106 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
StrnO55106 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
StrnO55106 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
StrnO55106 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
StrnO55106 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
StrnO55106 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
StrnO55106 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
StrnO55106 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
StrnO55106 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
StrnO55106 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
StrnO55106 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
StrnO55106 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
StrnO55106 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
StrnO55106 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
StrnO55106 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
StrnO55106 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
StrnO55106 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
StrnO55106 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
StrnO55106 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
StrnO55106 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
StrnO55106 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
StrnO55106 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
StrnO55106 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
StrnO55106 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
StrnO55106 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
StrnO55106 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
StrnO55106 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
StrnO55106 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
StrnO55106 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
StrnO55106 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
StrnO55106 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
StrnO55106 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
StrnO55106 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
StrnO55106 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
StrnO55106 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
StrnO55106 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
StrnO55106 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
StrnO55106 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
StrnO55106 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
StrnO55106 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
StrnO55106 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
StrnO55106 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
StrnO55106 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
StrnO55106 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
StrnO55106 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
StrnO55106 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
StrnO55106 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
StrnO55106 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms