Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ptpn20O55082 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ptpn20O55082 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ptpn20O55082 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ptpn20O55082 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ptpn20O55082 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ptpn20O55082 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ptpn20O55082 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ptpn20O55082 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ptpn20O55082 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ptpn20O55082 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ptpn20O55082 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ptpn20O55082 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ptpn20O55082 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ptpn20O55082 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ptpn20O55082 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ptpn20O55082 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ptpn20O55082 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ptpn20O55082 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ptpn20O55082 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ptpn20O55082 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ptpn20O55082 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ptpn20O55082 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ptpn20O55082 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ptpn20O55082 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ptpn20O55082 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ptpn20O55082 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Ptpn20O55082 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ptpn20O55082 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ptpn20O55082 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ptpn20O55082 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ptpn20O55082 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ptpn20O55082 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ptpn20O55082 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ptpn20O55082 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ptpn20O55082 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ptpn20O55082 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ptpn20O55082 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ptpn20O55082 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ptpn20O55082 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ptpn20O55082 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ptpn20O55082 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ptpn20O55082 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ptpn20O55082 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ptpn20O55082 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ptpn20O55082 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ptpn20O55082 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ptpn20O55082 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ptpn20O55082 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ptpn20O55082 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptpn20O55082 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptpn20O55082 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ptpn20O55082 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ptpn20O55082 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ptpn20O55082 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ptpn20O55082 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptpn20O55082 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptpn20O55082 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptpn20O55082 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptpn20O55082 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptpn20O55082 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ptpn20O55082 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ptpn20O55082 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptpn20O55082 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptpn20O55082 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptpn20O55082 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptpn20O55082 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptpn20O55082 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptpn20O55082 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptpn20O55082 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptpn20O55082 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptpn20O55082 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptpn20O55082 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptpn20O55082 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptpn20O55082 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptpn20O55082 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptpn20O55082 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptpn20O55082 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptpn20O55082 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptpn20O55082 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptpn20O55082 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptpn20O55082 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptpn20O55082 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptpn20O55082 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptpn20O55082 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptpn20O55082 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptpn20O55082 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptpn20O55082 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ptpn20O55082 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptpn20O55082 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptpn20O55082 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptpn20O55082 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptpn20O55082 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptpn20O55082 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptpn20O55082 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptpn20O55082 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptpn20O55082 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptpn20O55082 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptpn20O55082 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptpn20O55082 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 275.3 ms