Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trappc3O55013 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trappc3O55013 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trappc3O55013 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trappc3O55013 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trappc3O55013 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trappc3O55013 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trappc3O55013 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trappc3O55013 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trappc3O55013 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trappc3O55013 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trappc3O55013 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trappc3O55013 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trappc3O55013 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trappc3O55013 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trappc3O55013 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trappc3O55013 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trappc3O55013 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trappc3O55013 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trappc3O55013 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trappc3O55013 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trappc3O55013 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trappc3O55013 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Trappc3O55013 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trappc3O55013 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trappc3O55013 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trappc3O55013 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trappc3O55013 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Trappc3O55013 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trappc3O55013 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trappc3O55013 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trappc3O55013 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Trappc3O55013 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Trappc3O55013 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trappc3O55013 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trappc3O55013 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Trappc3O55013 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trappc3O55013 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trappc3O55013 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trappc3O55013 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trappc3O55013 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trappc3O55013 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trappc3O55013 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trappc3O55013 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trappc3O55013 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Trappc3O55013 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trappc3O55013 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Trappc3O55013 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Trappc3O55013 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trappc3O55013 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Trappc3O55013 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Trappc3O55013 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trappc3O55013 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trappc3O55013 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trappc3O55013 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trappc3O55013 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trappc3O55013 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trappc3O55013 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trappc3O55013 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trappc3O55013 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trappc3O55013 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trappc3O55013 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trappc3O55013 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trappc3O55013 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Trappc3O55013 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trappc3O55013 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trappc3O55013 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trappc3O55013 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trappc3O55013 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trappc3O55013 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Trappc3O55013 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trappc3O55013 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trappc3O55013 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trappc3O55013 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trappc3O55013 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trappc3O55013 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trappc3O55013 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trappc3O55013 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trappc3O55013 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Trappc3O55013 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trappc3O55013 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trappc3O55013 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trappc3O55013 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trappc3O55013 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trappc3O55013 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Trappc3O55013 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trappc3O55013 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trappc3O55013 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Trappc3O55013 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trappc3O55013 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trappc3O55013 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trappc3O55013 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trappc3O55013 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trappc3O55013 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trappc3O55013 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Trappc3O55013 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trappc3O55013 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Trappc3O55013 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trappc3O55013 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trappc3O55013 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 398 ms