Protein–RNA interactions for Protein: O54990

Prom1, Prominin-1, mousemouse

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prom1O54990 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29,85■■■□□ 2,37
Prom1O54990 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Prom1O54990 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29,82■■■□□ 2,36
Prom1O54990 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29,81■■■□□ 2,36
Prom1O54990 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Prom1O54990 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29,74■■■□□ 2,35
Prom1O54990 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Prom1O54990 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Prom1O54990 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Prom1O54990 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Prom1O54990 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Prom1O54990 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29,69■■■□□ 2,34
Prom1O54990 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Prom1O54990 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Prom1O54990 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Prom1O54990 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Prom1O54990 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29,65■■■□□ 2,34
Prom1O54990 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29,61■■■□□ 2,33
Prom1O54990 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29,61■■■□□ 2,33
Prom1O54990 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29,6■■■□□ 2,33
Prom1O54990 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Prom1O54990 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Prom1O54990 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Prom1O54990 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Prom1O54990 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Prom1O54990 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Prom1O54990 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29,54■■■□□ 2,32
Prom1O54990 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Prom1O54990 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Prom1O54990 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Prom1O54990 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Prom1O54990 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Prom1O54990 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,49■■■□□ 2,31
Prom1O54990 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,48■■■□□ 2,31
Prom1O54990 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29,48■■■□□ 2,31
Prom1O54990 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29,47■■■□□ 2,31
Prom1O54990 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29,42■■■□□ 2,3
Prom1O54990 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29,41■■■□□ 2,3
Prom1O54990 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Prom1O54990 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Prom1O54990 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Prom1O54990 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Prom1O54990 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Prom1O54990 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Prom1O54990 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29,3■■■□□ 2,28
Prom1O54990 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,28■■■□□ 2,28
Prom1O54990 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Prom1O54990 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,28
Prom1O54990 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Prom1O54990 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,25■■■□□ 2,27
Prom1O54990 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Prom1O54990 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Prom1O54990 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Prom1O54990 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29,21■■■□□ 2,27
Prom1O54990 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29,21■■■□□ 2,27
Prom1O54990 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29,19■■■□□ 2,26
Prom1O54990 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Prom1O54990 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Prom1O54990 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Prom1O54990 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Prom1O54990 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Prom1O54990 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Prom1O54990 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29,15■■■□□ 2,26
Prom1O54990 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Prom1O54990 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Prom1O54990 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,12■■■□□ 2,25
Prom1O54990 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Prom1O54990 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Prom1O54990 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Prom1O54990 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29,09■■■□□ 2,25
Prom1O54990 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29,09■■■□□ 2,25
Prom1O54990 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29,09■■■□□ 2,25
Prom1O54990 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Prom1O54990 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Prom1O54990 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Prom1O54990 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29,05■■■□□ 2,24
Prom1O54990 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Prom1O54990 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Prom1O54990 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Prom1O54990 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29,03■■■□□ 2,24
Prom1O54990 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Prom1O54990 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29,01■■■□□ 2,23
Prom1O54990 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Prom1O54990 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,98■■■□□ 2,23
Prom1O54990 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28,97■■■□□ 2,23
Prom1O54990 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Prom1O54990 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28,96■■■□□ 2,23
Prom1O54990 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,96■■■□□ 2,23
Prom1O54990 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Prom1O54990 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Prom1O54990 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Prom1O54990 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Prom1O54990 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Prom1O54990 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Prom1O54990 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Prom1O54990 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28,89■■■□□ 2,22
Prom1O54990 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Prom1O54990 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28,87■■■□□ 2,21
Prom1O54990 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Prom1O54990 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,85■■■□□ 2,21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70,6 ms