Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
E2f6O54917 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
E2f6O54917 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
E2f6O54917 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
E2f6O54917 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
E2f6O54917 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
E2f6O54917 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
E2f6O54917 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
E2f6O54917 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
E2f6O54917 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
E2f6O54917 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
E2f6O54917 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
E2f6O54917 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
E2f6O54917 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
E2f6O54917 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
E2f6O54917 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
E2f6O54917 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
E2f6O54917 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
E2f6O54917 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
E2f6O54917 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
E2f6O54917 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
E2f6O54917 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
E2f6O54917 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
E2f6O54917 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
E2f6O54917 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
E2f6O54917 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
E2f6O54917 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
E2f6O54917 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
E2f6O54917 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
E2f6O54917 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
E2f6O54917 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
E2f6O54917 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
E2f6O54917 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
E2f6O54917 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
E2f6O54917 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
E2f6O54917 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
E2f6O54917 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
E2f6O54917 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
E2f6O54917 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
E2f6O54917 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
E2f6O54917 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
E2f6O54917 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
E2f6O54917 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
E2f6O54917 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
E2f6O54917 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
E2f6O54917 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
E2f6O54917 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
E2f6O54917 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
E2f6O54917 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
E2f6O54917 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
E2f6O54917 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
E2f6O54917 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
E2f6O54917 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
E2f6O54917 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
E2f6O54917 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
E2f6O54917 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
E2f6O54917 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
E2f6O54917 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
E2f6O54917 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
E2f6O54917 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
E2f6O54917 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
E2f6O54917 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
E2f6O54917 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
E2f6O54917 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
E2f6O54917 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
E2f6O54917 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
E2f6O54917 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
E2f6O54917 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
E2f6O54917 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
E2f6O54917 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
E2f6O54917 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
E2f6O54917 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
E2f6O54917 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
E2f6O54917 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
E2f6O54917 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
E2f6O54917 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
E2f6O54917 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
E2f6O54917 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
E2f6O54917 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
E2f6O54917 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
E2f6O54917 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
E2f6O54917 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
E2f6O54917 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
E2f6O54917 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
E2f6O54917 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
E2f6O54917 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
E2f6O54917 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
E2f6O54917 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
E2f6O54917 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
E2f6O54917 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
E2f6O54917 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
E2f6O54917 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
E2f6O54917 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
E2f6O54917 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
E2f6O54917 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
E2f6O54917 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
E2f6O54917 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
E2f6O54917 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
E2f6O54917 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
E2f6O54917 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms