Protein–RNA interactions for Protein: O54689

Ccr6, C-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr6O54689 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccr6O54689 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccr6O54689 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccr6O54689 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccr6O54689 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccr6O54689 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccr6O54689 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccr6O54689 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccr6O54689 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccr6O54689 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccr6O54689 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccr6O54689 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccr6O54689 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccr6O54689 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccr6O54689 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccr6O54689 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccr6O54689 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccr6O54689 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccr6O54689 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccr6O54689 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccr6O54689 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccr6O54689 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccr6O54689 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccr6O54689 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccr6O54689 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccr6O54689 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccr6O54689 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccr6O54689 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccr6O54689 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccr6O54689 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccr6O54689 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccr6O54689 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccr6O54689 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccr6O54689 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccr6O54689 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccr6O54689 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccr6O54689 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccr6O54689 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccr6O54689 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccr6O54689 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccr6O54689 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccr6O54689 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccr6O54689 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccr6O54689 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccr6O54689 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccr6O54689 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccr6O54689 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccr6O54689 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccr6O54689 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccr6O54689 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccr6O54689 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccr6O54689 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccr6O54689 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccr6O54689 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccr6O54689 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccr6O54689 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccr6O54689 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccr6O54689 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccr6O54689 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccr6O54689 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccr6O54689 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccr6O54689 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccr6O54689 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccr6O54689 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccr6O54689 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccr6O54689 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccr6O54689 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccr6O54689 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccr6O54689 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccr6O54689 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccr6O54689 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccr6O54689 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccr6O54689 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccr6O54689 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccr6O54689 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccr6O54689 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccr6O54689 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccr6O54689 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccr6O54689 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccr6O54689 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccr6O54689 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccr6O54689 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccr6O54689 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccr6O54689 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccr6O54689 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccr6O54689 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccr6O54689 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccr6O54689 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccr6O54689 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccr6O54689 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccr6O54689 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccr6O54689 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccr6O54689 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccr6O54689 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccr6O54689 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccr6O54689 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccr6O54689 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccr6O54689 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccr6O54689 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccr6O54689 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms