Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Cited2O35740 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Cited2O35740 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20,85■□□□□ 0,93
Cited2O35740 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,85■□□□□ 0,93
Cited2O35740 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,93
Cited2O35740 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20,83■□□□□ 0,93
Cited2O35740 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,93
Cited2O35740 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,92
Cited2O35740 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,92
Cited2O35740 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
Cited2O35740 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
Cited2O35740 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20,81■□□□□ 0,92
Cited2O35740 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
Cited2O35740 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC20,81■□□□□ 0,92
Cited2O35740 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20,79■□□□□ 0,92
Cited2O35740 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Cited2O35740 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Cited2O35740 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,92
Cited2O35740 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,91
Cited2O35740 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,91
Cited2O35740 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Cited2O35740 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Cited2O35740 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
Cited2O35740 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
Cited2O35740 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20,75■□□□□ 0,91
Cited2O35740 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
Cited2O35740 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
Cited2O35740 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20,73■□□□□ 0,91
Cited2O35740 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Cited2O35740 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20,7■□□□□ 0,9
Cited2O35740 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20,66■□□□□ 0,9
Cited2O35740 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Cited2O35740 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Cited2O35740 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20,65■□□□□ 0,9
Cited2O35740 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,65■□□□□ 0,9
Cited2O35740 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,89
Cited2O35740 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,63■□□□□ 0,89
Cited2O35740 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20,63■□□□□ 0,89
Cited2O35740 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20,59■□□□□ 0,89
Cited2O35740 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
Cited2O35740 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20,58■□□□□ 0,89
Cited2O35740 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20,57■□□□□ 0,88
Cited2O35740 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20,57■□□□□ 0,88
Cited2O35740 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20,57■□□□□ 0,88
Cited2O35740 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
Cited2O35740 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,55■□□□□ 0,88
Cited2O35740 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,54■□□□□ 0,88
Cited2O35740 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,54■□□□□ 0,88
Cited2O35740 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
Cited2O35740 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
Cited2O35740 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Cited2O35740 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20,51■□□□□ 0,87
Cited2O35740 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Cited2O35740 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20,5■□□□□ 0,87
Cited2O35740 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Cited2O35740 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Cited2O35740 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Cited2O35740 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,47■□□□□ 0,87
Cited2O35740 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Cited2O35740 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
Cited2O35740 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
Cited2O35740 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC20,45■□□□□ 0,86
Cited2O35740 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20,45■□□□□ 0,86
Cited2O35740 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20,43■□□□□ 0,86
Cited2O35740 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
Cited2O35740 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Cited2O35740 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20,41■□□□□ 0,86
Cited2O35740 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20,41■□□□□ 0,86
Cited2O35740 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Cited2O35740 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,85
Cited2O35740 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,38■□□□□ 0,85
Cited2O35740 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,38■□□□□ 0,85
Cited2O35740 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
Cited2O35740 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20,34■□□□□ 0,85
Cited2O35740 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,34■□□□□ 0,85
Cited2O35740 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,34■□□□□ 0,85
Cited2O35740 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20,33■□□□□ 0,85
Cited2O35740 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,33■□□□□ 0,85
Cited2O35740 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20,33■□□□□ 0,85
Cited2O35740 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,33■□□□□ 0,85
Cited2O35740 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,31■□□□□ 0,84
Cited2O35740 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,31■□□□□ 0,84
Cited2O35740 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20,31■□□□□ 0,84
Cited2O35740 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,31■□□□□ 0,84
Cited2O35740 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,3■□□□□ 0,84
Cited2O35740 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,3■□□□□ 0,84
Cited2O35740 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20,3■□□□□ 0,84
Cited2O35740 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,29■□□□□ 0,84
Cited2O35740 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,29■□□□□ 0,84
Cited2O35740 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,29■□□□□ 0,84
Cited2O35740 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,28■□□□□ 0,84
Cited2O35740 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,28■□□□□ 0,84
Cited2O35740 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,26■□□□□ 0,83
Cited2O35740 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20,26■□□□□ 0,83
Cited2O35740 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,24■□□□□ 0,83
Cited2O35740 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20,24■□□□□ 0,83
Cited2O35740 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20,23■□□□□ 0,83
Cited2O35740 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20,23■□□□□ 0,83
Cited2O35740 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20,23■□□□□ 0,83
Cited2O35740 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,23■□□□□ 0,83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15,2 ms