Protein–RNA interactions for Protein: O08738

Casp6, Caspase-6, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp6O08738 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casp6O08738 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casp6O08738 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casp6O08738 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casp6O08738 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casp6O08738 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Casp6O08738 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casp6O08738 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casp6O08738 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casp6O08738 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casp6O08738 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casp6O08738 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Casp6O08738 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Casp6O08738 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casp6O08738 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casp6O08738 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Casp6O08738 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Casp6O08738 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Casp6O08738 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Casp6O08738 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Casp6O08738 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Casp6O08738 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Casp6O08738 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Casp6O08738 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Casp6O08738 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Casp6O08738 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Casp6O08738 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Casp6O08738 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Casp6O08738 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Casp6O08738 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Casp6O08738 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Casp6O08738 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Casp6O08738 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Casp6O08738 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Casp6O08738 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Casp6O08738 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casp6O08738 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casp6O08738 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casp6O08738 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casp6O08738 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casp6O08738 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Casp6O08738 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casp6O08738 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casp6O08738 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casp6O08738 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casp6O08738 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Casp6O08738 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casp6O08738 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casp6O08738 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casp6O08738 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Casp6O08738 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casp6O08738 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casp6O08738 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casp6O08738 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Casp6O08738 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casp6O08738 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casp6O08738 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casp6O08738 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casp6O08738 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casp6O08738 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casp6O08738 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casp6O08738 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casp6O08738 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casp6O08738 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Casp6O08738 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Casp6O08738 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Casp6O08738 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Casp6O08738 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Casp6O08738 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Casp6O08738 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casp6O08738 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casp6O08738 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Casp6O08738 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Casp6O08738 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Casp6O08738 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Casp6O08738 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Casp6O08738 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Casp6O08738 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Casp6O08738 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Casp6O08738 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Casp6O08738 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Casp6O08738 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Casp6O08738 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Casp6O08738 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Casp6O08738 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casp6O08738 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casp6O08738 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casp6O08738 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Casp6O08738 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Casp6O08738 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Casp6O08738 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casp6O08738 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casp6O08738 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casp6O08738 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casp6O08738 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casp6O08738 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casp6O08738 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casp6O08738 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casp6O08738 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casp6O08738 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms