Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD5

Gm9602, Predicted gene 9602, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9602J3QPD5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm9602J3QPD5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm9602J3QPD5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm9602J3QPD5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm9602J3QPD5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm9602J3QPD5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm9602J3QPD5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm9602J3QPD5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm9602J3QPD5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm9602J3QPD5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm9602J3QPD5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm9602J3QPD5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm9602J3QPD5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm9602J3QPD5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm9602J3QPD5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm9602J3QPD5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm9602J3QPD5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm9602J3QPD5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm9602J3QPD5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm9602J3QPD5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm9602J3QPD5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm9602J3QPD5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm9602J3QPD5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm9602J3QPD5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm9602J3QPD5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm9602J3QPD5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm9602J3QPD5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm9602J3QPD5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm9602J3QPD5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm9602J3QPD5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm9602J3QPD5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm9602J3QPD5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm9602J3QPD5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm9602J3QPD5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm9602J3QPD5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm9602J3QPD5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm9602J3QPD5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm9602J3QPD5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm9602J3QPD5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm9602J3QPD5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm9602J3QPD5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm9602J3QPD5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm9602J3QPD5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm9602J3QPD5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm9602J3QPD5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm9602J3QPD5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm9602J3QPD5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm9602J3QPD5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm9602J3QPD5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm9602J3QPD5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm9602J3QPD5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm9602J3QPD5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm9602J3QPD5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm9602J3QPD5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm9602J3QPD5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm9602J3QPD5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm9602J3QPD5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm9602J3QPD5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm9602J3QPD5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm9602J3QPD5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm9602J3QPD5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm9602J3QPD5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm9602J3QPD5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm9602J3QPD5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm9602J3QPD5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm9602J3QPD5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm9602J3QPD5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm9602J3QPD5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm9602J3QPD5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm9602J3QPD5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm9602J3QPD5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm9602J3QPD5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm9602J3QPD5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm9602J3QPD5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm9602J3QPD5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm9602J3QPD5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm9602J3QPD5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm9602J3QPD5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm9602J3QPD5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm9602J3QPD5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm9602J3QPD5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm9602J3QPD5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm9602J3QPD5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm9602J3QPD5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm9602J3QPD5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm9602J3QPD5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm9602J3QPD5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm9602J3QPD5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm9602J3QPD5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm9602J3QPD5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm9602J3QPD5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm9602J3QPD5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm9602J3QPD5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gm9602J3QPD5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm9602J3QPD5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm9602J3QPD5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm9602J3QPD5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm9602J3QPD5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm9602J3QPD5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm9602J3QPD5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms