Protein–RNA interactions for Protein: J3QNZ6

Gm21874, Predicted gene, 21874, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21874J3QNZ6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm21874J3QNZ6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm21874J3QNZ6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm21874J3QNZ6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm21874J3QNZ6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm21874J3QNZ6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm21874J3QNZ6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm21874J3QNZ6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm21874J3QNZ6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm21874J3QNZ6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm21874J3QNZ6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm21874J3QNZ6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm21874J3QNZ6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm21874J3QNZ6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm21874J3QNZ6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm21874J3QNZ6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm21874J3QNZ6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm21874J3QNZ6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm21874J3QNZ6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm21874J3QNZ6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm21874J3QNZ6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm21874J3QNZ6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm21874J3QNZ6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm21874J3QNZ6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm21874J3QNZ6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm21874J3QNZ6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm21874J3QNZ6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm21874J3QNZ6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm21874J3QNZ6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm21874J3QNZ6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm21874J3QNZ6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm21874J3QNZ6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm21874J3QNZ6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm21874J3QNZ6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm21874J3QNZ6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm21874J3QNZ6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm21874J3QNZ6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm21874J3QNZ6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm21874J3QNZ6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm21874J3QNZ6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm21874J3QNZ6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm21874J3QNZ6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm21874J3QNZ6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm21874J3QNZ6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm21874J3QNZ6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm21874J3QNZ6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm21874J3QNZ6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm21874J3QNZ6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm21874J3QNZ6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm21874J3QNZ6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm21874J3QNZ6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm21874J3QNZ6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm21874J3QNZ6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm21874J3QNZ6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm21874J3QNZ6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm21874J3QNZ6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm21874J3QNZ6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm21874J3QNZ6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm21874J3QNZ6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm21874J3QNZ6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm21874J3QNZ6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm21874J3QNZ6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm21874J3QNZ6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm21874J3QNZ6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm21874J3QNZ6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm21874J3QNZ6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm21874J3QNZ6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm21874J3QNZ6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm21874J3QNZ6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm21874J3QNZ6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm21874J3QNZ6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm21874J3QNZ6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gm21874J3QNZ6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm21874J3QNZ6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm21874J3QNZ6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm21874J3QNZ6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm21874J3QNZ6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm21874J3QNZ6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm21874J3QNZ6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm21874J3QNZ6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm21874J3QNZ6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm21874J3QNZ6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm21874J3QNZ6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm21874J3QNZ6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm21874J3QNZ6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm21874J3QNZ6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm21874J3QNZ6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm21874J3QNZ6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm21874J3QNZ6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm21874J3QNZ6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm21874J3QNZ6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm21874J3QNZ6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm21874J3QNZ6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm21874J3QNZ6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm21874J3QNZ6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gm21874J3QNZ6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm21874J3QNZ6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm21874J3QNZ6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm21874J3QNZ6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm21874J3QNZ6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms