Protein–RNA interactions for Protein: J3QNZ6

Gm21874, Predicted gene, 21874, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21874J3QNZ6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm21874J3QNZ6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm21874J3QNZ6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm21874J3QNZ6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm21874J3QNZ6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm21874J3QNZ6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm21874J3QNZ6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm21874J3QNZ6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm21874J3QNZ6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm21874J3QNZ6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm21874J3QNZ6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm21874J3QNZ6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm21874J3QNZ6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm21874J3QNZ6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm21874J3QNZ6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm21874J3QNZ6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm21874J3QNZ6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm21874J3QNZ6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm21874J3QNZ6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm21874J3QNZ6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm21874J3QNZ6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm21874J3QNZ6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm21874J3QNZ6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm21874J3QNZ6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm21874J3QNZ6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm21874J3QNZ6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm21874J3QNZ6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm21874J3QNZ6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm21874J3QNZ6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm21874J3QNZ6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm21874J3QNZ6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm21874J3QNZ6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm21874J3QNZ6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm21874J3QNZ6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm21874J3QNZ6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm21874J3QNZ6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm21874J3QNZ6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm21874J3QNZ6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm21874J3QNZ6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm21874J3QNZ6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm21874J3QNZ6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm21874J3QNZ6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm21874J3QNZ6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm21874J3QNZ6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm21874J3QNZ6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm21874J3QNZ6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm21874J3QNZ6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm21874J3QNZ6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm21874J3QNZ6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm21874J3QNZ6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm21874J3QNZ6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm21874J3QNZ6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm21874J3QNZ6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm21874J3QNZ6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm21874J3QNZ6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm21874J3QNZ6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm21874J3QNZ6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm21874J3QNZ6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm21874J3QNZ6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm21874J3QNZ6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm21874J3QNZ6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm21874J3QNZ6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm21874J3QNZ6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm21874J3QNZ6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm21874J3QNZ6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm21874J3QNZ6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm21874J3QNZ6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm21874J3QNZ6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm21874J3QNZ6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm21874J3QNZ6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm21874J3QNZ6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm21874J3QNZ6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gm21874J3QNZ6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm21874J3QNZ6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm21874J3QNZ6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm21874J3QNZ6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm21874J3QNZ6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm21874J3QNZ6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm21874J3QNZ6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm21874J3QNZ6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm21874J3QNZ6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm21874J3QNZ6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm21874J3QNZ6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm21874J3QNZ6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm21874J3QNZ6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm21874J3QNZ6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm21874J3QNZ6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm21874J3QNZ6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm21874J3QNZ6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm21874J3QNZ6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm21874J3QNZ6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm21874J3QNZ6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm21874J3QNZ6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm21874J3QNZ6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm21874J3QNZ6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gm21874J3QNZ6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm21874J3QNZ6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm21874J3QNZ6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm21874J3QNZ6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm21874J3QNZ6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms