Protein–RNA interactions for Protein: J3QJX6

7530416G11Rik, RIKEN cDNA 7530416G11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
7530416G11RikJ3QJX6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
7530416G11RikJ3QJX6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
7530416G11RikJ3QJX6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
7530416G11RikJ3QJX6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
7530416G11RikJ3QJX6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
7530416G11RikJ3QJX6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
7530416G11RikJ3QJX6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
7530416G11RikJ3QJX6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
7530416G11RikJ3QJX6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
7530416G11RikJ3QJX6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
7530416G11RikJ3QJX6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
7530416G11RikJ3QJX6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
7530416G11RikJ3QJX6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
7530416G11RikJ3QJX6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
7530416G11RikJ3QJX6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
7530416G11RikJ3QJX6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
7530416G11RikJ3QJX6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
7530416G11RikJ3QJX6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
7530416G11RikJ3QJX6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
7530416G11RikJ3QJX6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
7530416G11RikJ3QJX6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
7530416G11RikJ3QJX6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
7530416G11RikJ3QJX6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
7530416G11RikJ3QJX6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
7530416G11RikJ3QJX6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
7530416G11RikJ3QJX6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
7530416G11RikJ3QJX6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
7530416G11RikJ3QJX6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
7530416G11RikJ3QJX6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
7530416G11RikJ3QJX6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
7530416G11RikJ3QJX6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
7530416G11RikJ3QJX6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
7530416G11RikJ3QJX6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
7530416G11RikJ3QJX6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
7530416G11RikJ3QJX6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
7530416G11RikJ3QJX6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
7530416G11RikJ3QJX6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
7530416G11RikJ3QJX6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
7530416G11RikJ3QJX6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
7530416G11RikJ3QJX6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
7530416G11RikJ3QJX6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
7530416G11RikJ3QJX6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
7530416G11RikJ3QJX6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
7530416G11RikJ3QJX6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
7530416G11RikJ3QJX6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
7530416G11RikJ3QJX6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
7530416G11RikJ3QJX6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
7530416G11RikJ3QJX6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
7530416G11RikJ3QJX6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
7530416G11RikJ3QJX6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
7530416G11RikJ3QJX6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
7530416G11RikJ3QJX6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
7530416G11RikJ3QJX6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
7530416G11RikJ3QJX6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
7530416G11RikJ3QJX6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
7530416G11RikJ3QJX6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
7530416G11RikJ3QJX6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
7530416G11RikJ3QJX6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
7530416G11RikJ3QJX6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
7530416G11RikJ3QJX6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
7530416G11RikJ3QJX6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
7530416G11RikJ3QJX6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
7530416G11RikJ3QJX6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
7530416G11RikJ3QJX6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
7530416G11RikJ3QJX6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
7530416G11RikJ3QJX6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
7530416G11RikJ3QJX6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
7530416G11RikJ3QJX6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
7530416G11RikJ3QJX6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
7530416G11RikJ3QJX6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
7530416G11RikJ3QJX6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
7530416G11RikJ3QJX6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
7530416G11RikJ3QJX6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
7530416G11RikJ3QJX6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
7530416G11RikJ3QJX6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
7530416G11RikJ3QJX6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
7530416G11RikJ3QJX6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
7530416G11RikJ3QJX6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
7530416G11RikJ3QJX6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
7530416G11RikJ3QJX6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
7530416G11RikJ3QJX6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
7530416G11RikJ3QJX6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
7530416G11RikJ3QJX6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
7530416G11RikJ3QJX6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
7530416G11RikJ3QJX6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
7530416G11RikJ3QJX6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
7530416G11RikJ3QJX6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
7530416G11RikJ3QJX6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
7530416G11RikJ3QJX6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
7530416G11RikJ3QJX6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
7530416G11RikJ3QJX6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
7530416G11RikJ3QJX6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
7530416G11RikJ3QJX6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
7530416G11RikJ3QJX6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
7530416G11RikJ3QJX6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
7530416G11RikJ3QJX6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
7530416G11RikJ3QJX6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
7530416G11RikJ3QJX6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
7530416G11RikJ3QJX6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
7530416G11RikJ3QJX6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms