Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn1r58G3X9U3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn1r58G3X9U3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vmn1r58G3X9U3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r58G3X9U3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r58G3X9U3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r58G3X9U3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn1r58G3X9U3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r58G3X9U3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r58G3X9U3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r58G3X9U3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r58G3X9U3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r58G3X9U3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r58G3X9U3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r58G3X9U3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r58G3X9U3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r58G3X9U3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r58G3X9U3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r58G3X9U3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r58G3X9U3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r58G3X9U3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r58G3X9U3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r58G3X9U3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r58G3X9U3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r58G3X9U3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn1r58G3X9U3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r58G3X9U3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r58G3X9U3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn1r58G3X9U3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn1r58G3X9U3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn1r58G3X9U3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn1r58G3X9U3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r58G3X9U3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r58G3X9U3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vmn1r58G3X9U3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vmn1r58G3X9U3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn1r58G3X9U3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn1r58G3X9U3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn1r58G3X9U3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn1r58G3X9U3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn1r58G3X9U3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn1r58G3X9U3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r58G3X9U3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r58G3X9U3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r58G3X9U3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r58G3X9U3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn1r58G3X9U3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn1r58G3X9U3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn1r58G3X9U3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn1r58G3X9U3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn1r58G3X9U3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn1r58G3X9U3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn1r58G3X9U3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn1r58G3X9U3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn1r58G3X9U3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vmn1r58G3X9U3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vmn1r58G3X9U3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn1r58G3X9U3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn1r58G3X9U3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn1r58G3X9U3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn1r58G3X9U3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn1r58G3X9U3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn1r58G3X9U3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn1r58G3X9U3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn1r58G3X9U3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn1r58G3X9U3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn1r58G3X9U3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vmn1r58G3X9U3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vmn1r58G3X9U3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vmn1r58G3X9U3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn1r58G3X9U3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn1r58G3X9U3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn1r58G3X9U3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn1r58G3X9U3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn1r58G3X9U3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn1r58G3X9U3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn1r58G3X9U3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vmn1r58G3X9U3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn1r58G3X9U3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn1r58G3X9U3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn1r58G3X9U3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn1r58G3X9U3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn1r58G3X9U3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn1r58G3X9U3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn1r58G3X9U3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn1r58G3X9U3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vmn1r58G3X9U3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vmn1r58G3X9U3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn1r58G3X9U3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn1r58G3X9U3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn1r58G3X9U3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r58G3X9U3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r58G3X9U3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r58G3X9U3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r58G3X9U3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn1r58G3X9U3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn1r58G3X9U3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn1r58G3X9U3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn1r58G3X9U3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn1r58G3X9U3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms