Protein–RNA interactions for Protein: F6XX07

Gm21970, Predicted gene 21970 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21970F6XX07 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm21970F6XX07 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm21970F6XX07 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm21970F6XX07 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm21970F6XX07 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm21970F6XX07 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm21970F6XX07 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm21970F6XX07 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm21970F6XX07 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm21970F6XX07 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm21970F6XX07 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm21970F6XX07 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm21970F6XX07 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm21970F6XX07 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm21970F6XX07 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm21970F6XX07 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm21970F6XX07 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm21970F6XX07 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm21970F6XX07 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm21970F6XX07 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm21970F6XX07 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm21970F6XX07 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm21970F6XX07 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm21970F6XX07 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm21970F6XX07 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm21970F6XX07 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm21970F6XX07 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm21970F6XX07 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm21970F6XX07 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm21970F6XX07 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm21970F6XX07 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm21970F6XX07 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm21970F6XX07 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm21970F6XX07 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm21970F6XX07 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm21970F6XX07 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm21970F6XX07 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm21970F6XX07 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm21970F6XX07 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm21970F6XX07 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm21970F6XX07 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm21970F6XX07 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm21970F6XX07 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm21970F6XX07 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm21970F6XX07 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm21970F6XX07 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm21970F6XX07 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm21970F6XX07 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm21970F6XX07 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm21970F6XX07 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm21970F6XX07 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm21970F6XX07 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm21970F6XX07 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm21970F6XX07 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm21970F6XX07 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm21970F6XX07 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm21970F6XX07 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm21970F6XX07 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm21970F6XX07 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm21970F6XX07 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm21970F6XX07 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm21970F6XX07 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm21970F6XX07 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm21970F6XX07 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm21970F6XX07 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm21970F6XX07 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm21970F6XX07 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm21970F6XX07 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm21970F6XX07 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm21970F6XX07 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm21970F6XX07 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm21970F6XX07 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm21970F6XX07 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm21970F6XX07 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm21970F6XX07 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm21970F6XX07 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm21970F6XX07 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm21970F6XX07 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm21970F6XX07 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm21970F6XX07 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm21970F6XX07 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm21970F6XX07 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm21970F6XX07 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm21970F6XX07 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm21970F6XX07 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm21970F6XX07 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm21970F6XX07 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm21970F6XX07 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm21970F6XX07 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm21970F6XX07 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm21970F6XX07 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm21970F6XX07 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm21970F6XX07 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm21970F6XX07 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm21970F6XX07 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm21970F6XX07 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm21970F6XX07 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm21970F6XX07 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm21970F6XX07 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm21970F6XX07 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms