Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,34■■■□□ 2,29
Lmod3E9QA62 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Lmod3E9QA62 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Lmod3E9QA62 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Lmod3E9QA62 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Lmod3E9QA62 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29,31■■■□□ 2,28
Lmod3E9QA62 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29,29■■■□□ 2,28
Lmod3E9QA62 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Lmod3E9QA62 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Lmod3E9QA62 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Lmod3E9QA62 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29,22■■■□□ 2,27
Lmod3E9QA62 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Lmod3E9QA62 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Lmod3E9QA62 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Lmod3E9QA62 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Lmod3E9QA62 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Lmod3E9QA62 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Lmod3E9QA62 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Lmod3E9QA62 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Lmod3E9QA62 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29,19■■■□□ 2,26
Lmod3E9QA62 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Lmod3E9QA62 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29,16■■■□□ 2,26
Lmod3E9QA62 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,15■■■□□ 2,26
Lmod3E9QA62 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Lmod3E9QA62 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Lmod3E9QA62 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Lmod3E9QA62 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Lmod3E9QA62 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Lmod3E9QA62 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,12■■■□□ 2,25
Lmod3E9QA62 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Lmod3E9QA62 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Lmod3E9QA62 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29,09■■■□□ 2,25
Lmod3E9QA62 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Lmod3E9QA62 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Lmod3E9QA62 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Lmod3E9QA62 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Lmod3E9QA62 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Lmod3E9QA62 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29,07■■■□□ 2,24
Lmod3E9QA62 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29,06■■■□□ 2,24
Lmod3E9QA62 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Lmod3E9QA62 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Lmod3E9QA62 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Lmod3E9QA62 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Lmod3E9QA62 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Lmod3E9QA62 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Lmod3E9QA62 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Lmod3E9QA62 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Lmod3E9QA62 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Lmod3E9QA62 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Lmod3E9QA62 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Lmod3E9QA62 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28,98■■■□□ 2,23
Lmod3E9QA62 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Lmod3E9QA62 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28,95■■■□□ 2,22
Lmod3E9QA62 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Lmod3E9QA62 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,89■■■□□ 2,22
Lmod3E9QA62 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28,88■■■□□ 2,21
Lmod3E9QA62 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Lmod3E9QA62 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,84■■■□□ 2,21
Lmod3E9QA62 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Lmod3E9QA62 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Lmod3E9QA62 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Lmod3E9QA62 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Lmod3E9QA62 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Lmod3E9QA62 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Lmod3E9QA62 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Lmod3E9QA62 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Lmod3E9QA62 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Lmod3E9QA62 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Lmod3E9QA62 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Lmod3E9QA62 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Lmod3E9QA62 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,77■■■□□ 2,2
Lmod3E9QA62 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Lmod3E9QA62 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Lmod3E9QA62 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Lmod3E9QA62 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Lmod3E9QA62 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Lmod3E9QA62 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
Lmod3E9QA62 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC28,67■■■□□ 2,18
Lmod3E9QA62 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28,67■■■□□ 2,18
Lmod3E9QA62 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28,67■■■□□ 2,18
Lmod3E9QA62 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,65■■■□□ 2,18
Lmod3E9QA62 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Lmod3E9QA62 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,65■■■□□ 2,18
Lmod3E9QA62 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Lmod3E9QA62 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Lmod3E9QA62 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,62■■■□□ 2,17
Lmod3E9QA62 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,62■■■□□ 2,17
Lmod3E9QA62 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Lmod3E9QA62 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Lmod3E9QA62 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Lmod3E9QA62 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Lmod3E9QA62 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Lmod3E9QA62 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28,57■■■□□ 2,16
Lmod3E9QA62 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Lmod3E9QA62 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Lmod3E9QA62 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Lmod3E9QA62 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Lmod3E9QA62 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Lmod3E9QA62 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Lmod3E9QA62 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms