Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B5

Fcgbp, Fc fragment of IgG-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FcgbpE9Q0B5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21,11■□□□□ 0,97
FcgbpE9Q0B5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21,08■□□□□ 0,97
FcgbpE9Q0B5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
FcgbpE9Q0B5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
FcgbpE9Q0B5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
FcgbpE9Q0B5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,04■□□□□ 0,96
FcgbpE9Q0B5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21,03■□□□□ 0,96
FcgbpE9Q0B5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,02■□□□□ 0,95
FcgbpE9Q0B5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
FcgbpE9Q0B5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20,98■□□□□ 0,95
FcgbpE9Q0B5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20,98■□□□□ 0,95
FcgbpE9Q0B5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
FcgbpE9Q0B5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,95
FcgbpE9Q0B5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
FcgbpE9Q0B5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20,93■□□□□ 0,94
FcgbpE9Q0B5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC20,92■□□□□ 0,94
FcgbpE9Q0B5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
FcgbpE9Q0B5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20,87■□□□□ 0,93
FcgbpE9Q0B5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
FcgbpE9Q0B5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20,86■□□□□ 0,93
FcgbpE9Q0B5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
FcgbpE9Q0B5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,93
FcgbpE9Q0B5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20,83■□□□□ 0,93
FcgbpE9Q0B5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20,83■□□□□ 0,92
FcgbpE9Q0B5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
FcgbpE9Q0B5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20,82■□□□□ 0,92
FcgbpE9Q0B5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
FcgbpE9Q0B5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20,81■□□□□ 0,92
FcgbpE9Q0B5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
FcgbpE9Q0B5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
FcgbpE9Q0B5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
FcgbpE9Q0B5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20,8■□□□□ 0,92
FcgbpE9Q0B5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
FcgbpE9Q0B5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20,76■□□□□ 0,91
FcgbpE9Q0B5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20,76■□□□□ 0,91
FcgbpE9Q0B5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20,76■□□□□ 0,91
FcgbpE9Q0B5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20,74■□□□□ 0,91
FcgbpE9Q0B5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20,74■□□□□ 0,91
FcgbpE9Q0B5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
FcgbpE9Q0B5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
FcgbpE9Q0B5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20,72■□□□□ 0,91
FcgbpE9Q0B5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
FcgbpE9Q0B5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
FcgbpE9Q0B5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
FcgbpE9Q0B5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
FcgbpE9Q0B5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20,65■□□□□ 0,9
FcgbpE9Q0B5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,9
FcgbpE9Q0B5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,89
FcgbpE9Q0B5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
FcgbpE9Q0B5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,61■□□□□ 0,89
FcgbpE9Q0B5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,61■□□□□ 0,89
FcgbpE9Q0B5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20,6■□□□□ 0,89
FcgbpE9Q0B5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20,6■□□□□ 0,89
FcgbpE9Q0B5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20,58■□□□□ 0,89
FcgbpE9Q0B5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20,58■□□□□ 0,89
FcgbpE9Q0B5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,89
FcgbpE9Q0B5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20,53■□□□□ 0,88
FcgbpE9Q0B5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20,53■□□□□ 0,88
FcgbpE9Q0B5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20,53■□□□□ 0,88
FcgbpE9Q0B5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
FcgbpE9Q0B5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20,53■□□□□ 0,88
FcgbpE9Q0B5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
FcgbpE9Q0B5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20,5■□□□□ 0,87
FcgbpE9Q0B5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
FcgbpE9Q0B5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
FcgbpE9Q0B5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20,45■□□□□ 0,86
FcgbpE9Q0B5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
FcgbpE9Q0B5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20,45■□□□□ 0,86
FcgbpE9Q0B5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
FcgbpE9Q0B5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
FcgbpE9Q0B5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
FcgbpE9Q0B5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
FcgbpE9Q0B5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
FcgbpE9Q0B5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
FcgbpE9Q0B5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
FcgbpE9Q0B5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
FcgbpE9Q0B5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20,4■□□□□ 0,86
FcgbpE9Q0B5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,39■□□□□ 0,85
FcgbpE9Q0B5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
FcgbpE9Q0B5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
FcgbpE9Q0B5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
FcgbpE9Q0B5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
FcgbpE9Q0B5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20,34■□□□□ 0,85
FcgbpE9Q0B5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,34■□□□□ 0,85
FcgbpE9Q0B5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC20,32■□□□□ 0,84
FcgbpE9Q0B5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,31■□□□□ 0,84
FcgbpE9Q0B5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20,31■□□□□ 0,84
FcgbpE9Q0B5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20,29■□□□□ 0,84
FcgbpE9Q0B5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,27■□□□□ 0,84
FcgbpE9Q0B5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20,26■□□□□ 0,83
FcgbpE9Q0B5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,26■□□□□ 0,83
FcgbpE9Q0B5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,26■□□□□ 0,83
FcgbpE9Q0B5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20,25■□□□□ 0,83
FcgbpE9Q0B5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20,24■□□□□ 0,83
FcgbpE9Q0B5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20,24■□□□□ 0,83
FcgbpE9Q0B5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20,24■□□□□ 0,83
FcgbpE9Q0B5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20,22■□□□□ 0,83
FcgbpE9Q0B5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20,22■□□□□ 0,83
FcgbpE9Q0B5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,21■□□□□ 0,83
FcgbpE9Q0B5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20,19■□□□□ 0,82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,3 ms