Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF8

Sbf2, SET-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbf2E9PXF8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Sbf2E9PXF8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Sbf2E9PXF8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Sbf2E9PXF8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Sbf2E9PXF8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Sbf2E9PXF8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Sbf2E9PXF8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Sbf2E9PXF8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2,39
Sbf2E9PXF8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29,99■■■□□ 2,39
Sbf2E9PXF8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Sbf2E9PXF8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Sbf2E9PXF8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Sbf2E9PXF8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Sbf2E9PXF8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Sbf2E9PXF8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29,97■■■□□ 2,39
Sbf2E9PXF8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Sbf2E9PXF8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Sbf2E9PXF8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29,93■■■□□ 2,38
Sbf2E9PXF8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29,89■■■□□ 2,37
Sbf2E9PXF8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Sbf2E9PXF8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29,87■■■□□ 2,37
Sbf2E9PXF8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Sbf2E9PXF8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,86■■■□□ 2,37
Sbf2E9PXF8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Sbf2E9PXF8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Sbf2E9PXF8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Sbf2E9PXF8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29,78■■■□□ 2,36
Sbf2E9PXF8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Sbf2E9PXF8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29,76■■■□□ 2,35
Sbf2E9PXF8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Sbf2E9PXF8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Sbf2E9PXF8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,73■■■□□ 2,35
Sbf2E9PXF8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29,72■■■□□ 2,35
Sbf2E9PXF8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29,72■■■□□ 2,35
Sbf2E9PXF8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,35
Sbf2E9PXF8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Sbf2E9PXF8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Sbf2E9PXF8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29,68■■■□□ 2,34
Sbf2E9PXF8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29,68■■■□□ 2,34
Sbf2E9PXF8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Sbf2E9PXF8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Sbf2E9PXF8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Sbf2E9PXF8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Sbf2E9PXF8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Sbf2E9PXF8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29,55■■■□□ 2,32
Sbf2E9PXF8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Sbf2E9PXF8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Sbf2E9PXF8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29,53■■■□□ 2,32
Sbf2E9PXF8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Sbf2E9PXF8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29,53■■■□□ 2,32
Sbf2E9PXF8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29,53■■■□□ 2,32
Sbf2E9PXF8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,32
Sbf2E9PXF8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Sbf2E9PXF8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Sbf2E9PXF8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Sbf2E9PXF8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,47■■■□□ 2,31
Sbf2E9PXF8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,3
Sbf2E9PXF8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Sbf2E9PXF8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Sbf2E9PXF8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,42■■■□□ 2,3
Sbf2E9PXF8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Sbf2E9PXF8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29,39■■■□□ 2,3
Sbf2E9PXF8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Sbf2E9PXF8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Sbf2E9PXF8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Sbf2E9PXF8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Sbf2E9PXF8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Sbf2E9PXF8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Sbf2E9PXF8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Sbf2E9PXF8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Sbf2E9PXF8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,35■■■□□ 2,29
Sbf2E9PXF8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Sbf2E9PXF8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,34■■■□□ 2,29
Sbf2E9PXF8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29,34■■■□□ 2,29
Sbf2E9PXF8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Sbf2E9PXF8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29,31■■■□□ 2,28
Sbf2E9PXF8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Sbf2E9PXF8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29,3■■■□□ 2,28
Sbf2E9PXF8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29,29■■■□□ 2,28
Sbf2E9PXF8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Sbf2E9PXF8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29,27■■■□□ 2,28
Sbf2E9PXF8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29,27■■■□□ 2,28
Sbf2E9PXF8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Sbf2E9PXF8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29,27■■■□□ 2,28
Sbf2E9PXF8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,28
Sbf2E9PXF8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29,26■■■□□ 2,27
Sbf2E9PXF8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Sbf2E9PXF8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Sbf2E9PXF8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,24■■■□□ 2,27
Sbf2E9PXF8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,24■■■□□ 2,27
Sbf2E9PXF8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Sbf2E9PXF8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Sbf2E9PXF8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29,21■■■□□ 2,27
Sbf2E9PXF8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29,21■■■□□ 2,27
Sbf2E9PXF8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,27
Sbf2E9PXF8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Sbf2E9PXF8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29,19■■■□□ 2,26
Sbf2E9PXF8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Sbf2E9PXF8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29,18■■■□□ 2,26
Sbf2E9PXF8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29,18■■■□□ 2,26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,4 ms