Protein–RNA interactions for Protein: D6MZJ6

Smpd5, MCG22096, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd5D6MZJ6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Smpd5D6MZJ6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Smpd5D6MZJ6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Smpd5D6MZJ6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smpd5D6MZJ6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smpd5D6MZJ6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smpd5D6MZJ6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smpd5D6MZJ6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Smpd5D6MZJ6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smpd5D6MZJ6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smpd5D6MZJ6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smpd5D6MZJ6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smpd5D6MZJ6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smpd5D6MZJ6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smpd5D6MZJ6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smpd5D6MZJ6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smpd5D6MZJ6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smpd5D6MZJ6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smpd5D6MZJ6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smpd5D6MZJ6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smpd5D6MZJ6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smpd5D6MZJ6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smpd5D6MZJ6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smpd5D6MZJ6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smpd5D6MZJ6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smpd5D6MZJ6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smpd5D6MZJ6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Smpd5D6MZJ6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smpd5D6MZJ6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smpd5D6MZJ6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smpd5D6MZJ6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smpd5D6MZJ6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smpd5D6MZJ6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smpd5D6MZJ6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smpd5D6MZJ6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smpd5D6MZJ6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Smpd5D6MZJ6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Smpd5D6MZJ6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smpd5D6MZJ6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Smpd5D6MZJ6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smpd5D6MZJ6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smpd5D6MZJ6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smpd5D6MZJ6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smpd5D6MZJ6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smpd5D6MZJ6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smpd5D6MZJ6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smpd5D6MZJ6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smpd5D6MZJ6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smpd5D6MZJ6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smpd5D6MZJ6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smpd5D6MZJ6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smpd5D6MZJ6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smpd5D6MZJ6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smpd5D6MZJ6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smpd5D6MZJ6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smpd5D6MZJ6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smpd5D6MZJ6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smpd5D6MZJ6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Smpd5D6MZJ6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smpd5D6MZJ6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Smpd5D6MZJ6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smpd5D6MZJ6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smpd5D6MZJ6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smpd5D6MZJ6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smpd5D6MZJ6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smpd5D6MZJ6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smpd5D6MZJ6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smpd5D6MZJ6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smpd5D6MZJ6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smpd5D6MZJ6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smpd5D6MZJ6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smpd5D6MZJ6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smpd5D6MZJ6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smpd5D6MZJ6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smpd5D6MZJ6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smpd5D6MZJ6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smpd5D6MZJ6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smpd5D6MZJ6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smpd5D6MZJ6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smpd5D6MZJ6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smpd5D6MZJ6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smpd5D6MZJ6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smpd5D6MZJ6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smpd5D6MZJ6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smpd5D6MZJ6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smpd5D6MZJ6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smpd5D6MZJ6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smpd5D6MZJ6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smpd5D6MZJ6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smpd5D6MZJ6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smpd5D6MZJ6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smpd5D6MZJ6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Smpd5D6MZJ6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Smpd5D6MZJ6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smpd5D6MZJ6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smpd5D6MZJ6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smpd5D6MZJ6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smpd5D6MZJ6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smpd5D6MZJ6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smpd5D6MZJ6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms