Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6L3

Vmn2r49, Vomeronasal 2, receptor 49, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r49D3Z6L3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Vmn2r49D3Z6L3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vmn2r49D3Z6L3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vmn2r49D3Z6L3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Vmn2r49D3Z6L3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vmn2r49D3Z6L3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vmn2r49D3Z6L3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vmn2r49D3Z6L3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vmn2r49D3Z6L3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vmn2r49D3Z6L3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vmn2r49D3Z6L3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vmn2r49D3Z6L3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vmn2r49D3Z6L3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vmn2r49D3Z6L3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vmn2r49D3Z6L3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vmn2r49D3Z6L3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vmn2r49D3Z6L3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vmn2r49D3Z6L3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vmn2r49D3Z6L3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vmn2r49D3Z6L3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Vmn2r49D3Z6L3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vmn2r49D3Z6L3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vmn2r49D3Z6L3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Vmn2r49D3Z6L3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vmn2r49D3Z6L3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vmn2r49D3Z6L3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vmn2r49D3Z6L3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vmn2r49D3Z6L3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Vmn2r49D3Z6L3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vmn2r49D3Z6L3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vmn2r49D3Z6L3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vmn2r49D3Z6L3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vmn2r49D3Z6L3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vmn2r49D3Z6L3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vmn2r49D3Z6L3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vmn2r49D3Z6L3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vmn2r49D3Z6L3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vmn2r49D3Z6L3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vmn2r49D3Z6L3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vmn2r49D3Z6L3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vmn2r49D3Z6L3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Vmn2r49D3Z6L3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vmn2r49D3Z6L3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vmn2r49D3Z6L3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vmn2r49D3Z6L3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vmn2r49D3Z6L3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vmn2r49D3Z6L3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vmn2r49D3Z6L3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vmn2r49D3Z6L3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vmn2r49D3Z6L3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vmn2r49D3Z6L3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vmn2r49D3Z6L3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Vmn2r49D3Z6L3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vmn2r49D3Z6L3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vmn2r49D3Z6L3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vmn2r49D3Z6L3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vmn2r49D3Z6L3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Vmn2r49D3Z6L3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vmn2r49D3Z6L3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vmn2r49D3Z6L3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vmn2r49D3Z6L3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vmn2r49D3Z6L3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vmn2r49D3Z6L3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vmn2r49D3Z6L3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vmn2r49D3Z6L3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vmn2r49D3Z6L3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vmn2r49D3Z6L3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vmn2r49D3Z6L3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vmn2r49D3Z6L3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn2r49D3Z6L3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn2r49D3Z6L3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn2r49D3Z6L3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn2r49D3Z6L3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmn2r49D3Z6L3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmn2r49D3Z6L3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn2r49D3Z6L3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn2r49D3Z6L3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn2r49D3Z6L3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmn2r49D3Z6L3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vmn2r49D3Z6L3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vmn2r49D3Z6L3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vmn2r49D3Z6L3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vmn2r49D3Z6L3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn2r49D3Z6L3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn2r49D3Z6L3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vmn2r49D3Z6L3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vmn2r49D3Z6L3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn2r49D3Z6L3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn2r49D3Z6L3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn2r49D3Z6L3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn2r49D3Z6L3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn2r49D3Z6L3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vmn2r49D3Z6L3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vmn2r49D3Z6L3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vmn2r49D3Z6L3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn2r49D3Z6L3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn2r49D3Z6L3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn2r49D3Z6L3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn2r49D3Z6L3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn2r49D3Z6L3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 194.4 ms