Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Samd1D3YXK1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Samd1D3YXK1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Samd1D3YXK1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Samd1D3YXK1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Samd1D3YXK1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Samd1D3YXK1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Samd1D3YXK1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Samd1D3YXK1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Samd1D3YXK1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Samd1D3YXK1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Samd1D3YXK1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Samd1D3YXK1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Samd1D3YXK1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Samd1D3YXK1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Samd1D3YXK1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Samd1D3YXK1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Samd1D3YXK1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Samd1D3YXK1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Samd1D3YXK1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Samd1D3YXK1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Samd1D3YXK1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Samd1D3YXK1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Samd1D3YXK1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Samd1D3YXK1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Samd1D3YXK1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Samd1D3YXK1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Samd1D3YXK1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Samd1D3YXK1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Samd1D3YXK1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Samd1D3YXK1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Samd1D3YXK1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Samd1D3YXK1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Samd1D3YXK1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Samd1D3YXK1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Samd1D3YXK1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Samd1D3YXK1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Samd1D3YXK1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Samd1D3YXK1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Samd1D3YXK1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Samd1D3YXK1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Samd1D3YXK1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Samd1D3YXK1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Samd1D3YXK1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Samd1D3YXK1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Samd1D3YXK1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Samd1D3YXK1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Samd1D3YXK1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Samd1D3YXK1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Samd1D3YXK1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Samd1D3YXK1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Samd1D3YXK1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Samd1D3YXK1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Samd1D3YXK1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Samd1D3YXK1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Samd1D3YXK1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Samd1D3YXK1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Samd1D3YXK1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Samd1D3YXK1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Samd1D3YXK1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Samd1D3YXK1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Samd1D3YXK1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Samd1D3YXK1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Samd1D3YXK1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Samd1D3YXK1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Samd1D3YXK1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Samd1D3YXK1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Samd1D3YXK1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Samd1D3YXK1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Samd1D3YXK1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Samd1D3YXK1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Samd1D3YXK1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Samd1D3YXK1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Samd1D3YXK1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Samd1D3YXK1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Samd1D3YXK1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Samd1D3YXK1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Samd1D3YXK1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Samd1D3YXK1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Samd1D3YXK1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Samd1D3YXK1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Samd1D3YXK1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Samd1D3YXK1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Samd1D3YXK1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Samd1D3YXK1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Samd1D3YXK1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Samd1D3YXK1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Samd1D3YXK1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Samd1D3YXK1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Samd1D3YXK1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Samd1D3YXK1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Samd1D3YXK1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Samd1D3YXK1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Samd1D3YXK1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Samd1D3YXK1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Samd1D3YXK1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Samd1D3YXK1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Samd1D3YXK1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Samd1D3YXK1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Samd1D3YXK1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms