Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
AU015836B2RUM3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
AU015836B2RUM3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
AU015836B2RUM3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
AU015836B2RUM3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
AU015836B2RUM3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
AU015836B2RUM3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
AU015836B2RUM3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
AU015836B2RUM3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
AU015836B2RUM3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
AU015836B2RUM3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
AU015836B2RUM3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
AU015836B2RUM3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
AU015836B2RUM3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
AU015836B2RUM3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
AU015836B2RUM3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
AU015836B2RUM3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
AU015836B2RUM3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
AU015836B2RUM3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
AU015836B2RUM3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
AU015836B2RUM3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
AU015836B2RUM3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
AU015836B2RUM3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
AU015836B2RUM3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
AU015836B2RUM3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
AU015836B2RUM3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
AU015836B2RUM3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
AU015836B2RUM3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
AU015836B2RUM3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
AU015836B2RUM3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
AU015836B2RUM3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
AU015836B2RUM3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
AU015836B2RUM3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
AU015836B2RUM3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
AU015836B2RUM3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
AU015836B2RUM3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
AU015836B2RUM3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
AU015836B2RUM3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
AU015836B2RUM3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
AU015836B2RUM3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
AU015836B2RUM3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
AU015836B2RUM3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
AU015836B2RUM3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
AU015836B2RUM3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
AU015836B2RUM3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
AU015836B2RUM3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
AU015836B2RUM3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
AU015836B2RUM3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
AU015836B2RUM3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
AU015836B2RUM3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
AU015836B2RUM3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
AU015836B2RUM3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
AU015836B2RUM3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
AU015836B2RUM3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
AU015836B2RUM3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
AU015836B2RUM3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
AU015836B2RUM3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
AU015836B2RUM3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
AU015836B2RUM3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
AU015836B2RUM3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
AU015836B2RUM3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
AU015836B2RUM3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
AU015836B2RUM3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
AU015836B2RUM3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
AU015836B2RUM3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
AU015836B2RUM3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
AU015836B2RUM3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
AU015836B2RUM3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
AU015836B2RUM3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
AU015836B2RUM3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
AU015836B2RUM3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
AU015836B2RUM3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
AU015836B2RUM3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
AU015836B2RUM3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
AU015836B2RUM3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
AU015836B2RUM3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
AU015836B2RUM3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
AU015836B2RUM3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
AU015836B2RUM3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
AU015836B2RUM3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
AU015836B2RUM3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
AU015836B2RUM3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
AU015836B2RUM3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
AU015836B2RUM3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
AU015836B2RUM3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
AU015836B2RUM3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
AU015836B2RUM3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
AU015836B2RUM3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
AU015836B2RUM3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
AU015836B2RUM3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
AU015836B2RUM3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
AU015836B2RUM3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
AU015836B2RUM3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
AU015836B2RUM3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
AU015836B2RUM3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
AU015836B2RUM3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
AU015836B2RUM3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
AU015836B2RUM3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
AU015836B2RUM3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
AU015836B2RUM3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms