Protein–RNA interactions for Protein: A2AUQ8

4930402F06Rik, MCG21268, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930402F06RikA2AUQ8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930402F06RikA2AUQ8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930402F06RikA2AUQ8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930402F06RikA2AUQ8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930402F06RikA2AUQ8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930402F06RikA2AUQ8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930402F06RikA2AUQ8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930402F06RikA2AUQ8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930402F06RikA2AUQ8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930402F06RikA2AUQ8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930402F06RikA2AUQ8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930402F06RikA2AUQ8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930402F06RikA2AUQ8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930402F06RikA2AUQ8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930402F06RikA2AUQ8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930402F06RikA2AUQ8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930402F06RikA2AUQ8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930402F06RikA2AUQ8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930402F06RikA2AUQ8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930402F06RikA2AUQ8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4930402F06RikA2AUQ8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
4930402F06RikA2AUQ8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4930402F06RikA2AUQ8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4930402F06RikA2AUQ8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
4930402F06RikA2AUQ8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4930402F06RikA2AUQ8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4930402F06RikA2AUQ8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
4930402F06RikA2AUQ8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4930402F06RikA2AUQ8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930402F06RikA2AUQ8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930402F06RikA2AUQ8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930402F06RikA2AUQ8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930402F06RikA2AUQ8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
4930402F06RikA2AUQ8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4930402F06RikA2AUQ8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4930402F06RikA2AUQ8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930402F06RikA2AUQ8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
4930402F06RikA2AUQ8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4930402F06RikA2AUQ8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
4930402F06RikA2AUQ8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4930402F06RikA2AUQ8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4930402F06RikA2AUQ8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4930402F06RikA2AUQ8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4930402F06RikA2AUQ8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930402F06RikA2AUQ8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930402F06RikA2AUQ8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930402F06RikA2AUQ8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930402F06RikA2AUQ8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930402F06RikA2AUQ8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
4930402F06RikA2AUQ8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
4930402F06RikA2AUQ8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930402F06RikA2AUQ8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930402F06RikA2AUQ8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930402F06RikA2AUQ8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930402F06RikA2AUQ8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930402F06RikA2AUQ8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
4930402F06RikA2AUQ8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930402F06RikA2AUQ8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930402F06RikA2AUQ8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930402F06RikA2AUQ8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930402F06RikA2AUQ8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930402F06RikA2AUQ8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930402F06RikA2AUQ8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930402F06RikA2AUQ8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
4930402F06RikA2AUQ8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930402F06RikA2AUQ8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930402F06RikA2AUQ8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930402F06RikA2AUQ8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930402F06RikA2AUQ8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930402F06RikA2AUQ8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930402F06RikA2AUQ8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930402F06RikA2AUQ8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930402F06RikA2AUQ8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930402F06RikA2AUQ8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930402F06RikA2AUQ8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930402F06RikA2AUQ8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930402F06RikA2AUQ8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
4930402F06RikA2AUQ8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930402F06RikA2AUQ8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930402F06RikA2AUQ8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930402F06RikA2AUQ8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930402F06RikA2AUQ8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930402F06RikA2AUQ8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930402F06RikA2AUQ8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930402F06RikA2AUQ8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930402F06RikA2AUQ8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930402F06RikA2AUQ8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930402F06RikA2AUQ8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930402F06RikA2AUQ8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930402F06RikA2AUQ8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930402F06RikA2AUQ8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930402F06RikA2AUQ8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930402F06RikA2AUQ8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930402F06RikA2AUQ8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930402F06RikA2AUQ8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
4930402F06RikA2AUQ8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
4930402F06RikA2AUQ8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930402F06RikA2AUQ8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930402F06RikA2AUQ8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930402F06RikA2AUQ8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 202.2 ms