Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CtcflA2APF3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CtcflA2APF3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CtcflA2APF3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CtcflA2APF3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CtcflA2APF3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CtcflA2APF3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CtcflA2APF3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CtcflA2APF3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CtcflA2APF3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CtcflA2APF3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CtcflA2APF3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CtcflA2APF3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CtcflA2APF3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CtcflA2APF3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CtcflA2APF3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CtcflA2APF3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CtcflA2APF3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CtcflA2APF3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CtcflA2APF3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CtcflA2APF3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CtcflA2APF3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CtcflA2APF3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CtcflA2APF3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CtcflA2APF3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CtcflA2APF3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CtcflA2APF3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CtcflA2APF3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CtcflA2APF3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CtcflA2APF3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CtcflA2APF3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CtcflA2APF3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CtcflA2APF3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CtcflA2APF3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CtcflA2APF3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CtcflA2APF3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CtcflA2APF3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CtcflA2APF3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CtcflA2APF3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CtcflA2APF3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CtcflA2APF3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CtcflA2APF3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CtcflA2APF3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CtcflA2APF3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CtcflA2APF3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CtcflA2APF3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CtcflA2APF3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CtcflA2APF3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CtcflA2APF3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CtcflA2APF3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CtcflA2APF3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CtcflA2APF3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CtcflA2APF3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CtcflA2APF3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CtcflA2APF3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CtcflA2APF3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CtcflA2APF3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CtcflA2APF3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CtcflA2APF3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtcflA2APF3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CtcflA2APF3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CtcflA2APF3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CtcflA2APF3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CtcflA2APF3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtcflA2APF3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CtcflA2APF3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CtcflA2APF3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CtcflA2APF3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CtcflA2APF3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CtcflA2APF3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtcflA2APF3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtcflA2APF3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CtcflA2APF3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CtcflA2APF3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CtcflA2APF3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CtcflA2APF3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CtcflA2APF3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CtcflA2APF3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CtcflA2APF3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CtcflA2APF3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtcflA2APF3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CtcflA2APF3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CtcflA2APF3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CtcflA2APF3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CtcflA2APF3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CtcflA2APF3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CtcflA2APF3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CtcflA2APF3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CtcflA2APF3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtcflA2APF3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtcflA2APF3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtcflA2APF3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CtcflA2APF3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CtcflA2APF3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CtcflA2APF3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CtcflA2APF3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CtcflA2APF3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CtcflA2APF3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CtcflA2APF3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CtcflA2APF3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms