Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930447F04RikA2AFR2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
4930447F04RikA2AFR2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4930447F04RikA2AFR2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
4930447F04RikA2AFR2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4930447F04RikA2AFR2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4930447F04RikA2AFR2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4930447F04RikA2AFR2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4930447F04RikA2AFR2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4930447F04RikA2AFR2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4930447F04RikA2AFR2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4930447F04RikA2AFR2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4930447F04RikA2AFR2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4930447F04RikA2AFR2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
4930447F04RikA2AFR2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930447F04RikA2AFR2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930447F04RikA2AFR2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
4930447F04RikA2AFR2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
4930447F04RikA2AFR2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
4930447F04RikA2AFR2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
4930447F04RikA2AFR2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
4930447F04RikA2AFR2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
4930447F04RikA2AFR2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
4930447F04RikA2AFR2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4930447F04RikA2AFR2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
4930447F04RikA2AFR2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4930447F04RikA2AFR2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4930447F04RikA2AFR2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
4930447F04RikA2AFR2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4930447F04RikA2AFR2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4930447F04RikA2AFR2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4930447F04RikA2AFR2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4930447F04RikA2AFR2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
4930447F04RikA2AFR2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4930447F04RikA2AFR2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
4930447F04RikA2AFR2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4930447F04RikA2AFR2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4930447F04RikA2AFR2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4930447F04RikA2AFR2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4930447F04RikA2AFR2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930447F04RikA2AFR2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930447F04RikA2AFR2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930447F04RikA2AFR2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930447F04RikA2AFR2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930447F04RikA2AFR2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930447F04RikA2AFR2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930447F04RikA2AFR2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930447F04RikA2AFR2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
4930447F04RikA2AFR2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930447F04RikA2AFR2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930447F04RikA2AFR2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930447F04RikA2AFR2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
4930447F04RikA2AFR2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4930447F04RikA2AFR2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930447F04RikA2AFR2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4930447F04RikA2AFR2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
4930447F04RikA2AFR2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
4930447F04RikA2AFR2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930447F04RikA2AFR2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930447F04RikA2AFR2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4930447F04RikA2AFR2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4930447F04RikA2AFR2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4930447F04RikA2AFR2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
4930447F04RikA2AFR2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4930447F04RikA2AFR2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4930447F04RikA2AFR2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
4930447F04RikA2AFR2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930447F04RikA2AFR2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930447F04RikA2AFR2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930447F04RikA2AFR2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930447F04RikA2AFR2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930447F04RikA2AFR2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930447F04RikA2AFR2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930447F04RikA2AFR2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930447F04RikA2AFR2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930447F04RikA2AFR2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930447F04RikA2AFR2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930447F04RikA2AFR2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930447F04RikA2AFR2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930447F04RikA2AFR2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930447F04RikA2AFR2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930447F04RikA2AFR2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930447F04RikA2AFR2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930447F04RikA2AFR2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930447F04RikA2AFR2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930447F04RikA2AFR2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930447F04RikA2AFR2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
4930447F04RikA2AFR2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
4930447F04RikA2AFR2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
4930447F04RikA2AFR2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
4930447F04RikA2AFR2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930447F04RikA2AFR2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930447F04RikA2AFR2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930447F04RikA2AFR2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930447F04RikA2AFR2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
4930447F04RikA2AFR2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930447F04RikA2AFR2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930447F04RikA2AFR2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930447F04RikA2AFR2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930447F04RikA2AFR2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.7 ms