Protein–RNA interactions for Protein: A2ABU4

Myom3, Myomesin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myom3A2ABU4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Myom3A2ABU4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC38.7■■■■□ 3.79
Myom3A2ABU4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Myom3A2ABU4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Myom3A2ABU4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Myom3A2ABU4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC38.65■■■■□ 3.78
Myom3A2ABU4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Myom3A2ABU4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC38.64■■■■□ 3.78
Myom3A2ABU4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
Myom3A2ABU4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Myom3A2ABU4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
Myom3A2ABU4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
Myom3A2ABU4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Myom3A2ABU4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC38.54■■■■□ 3.76
Myom3A2ABU4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
Myom3A2ABU4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Myom3A2ABU4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Myom3A2ABU4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Myom3A2ABU4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Myom3A2ABU4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
Myom3A2ABU4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Myom3A2ABU4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Myom3A2ABU4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Myom3A2ABU4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Myom3A2ABU4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
Myom3A2ABU4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
Myom3A2ABU4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Myom3A2ABU4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
Myom3A2ABU4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
Myom3A2ABU4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
Myom3A2ABU4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
Myom3A2ABU4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Myom3A2ABU4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Myom3A2ABU4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Myom3A2ABU4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Myom3A2ABU4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Myom3A2ABU4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Myom3A2ABU4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Myom3A2ABU4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
Myom3A2ABU4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Myom3A2ABU4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Myom3A2ABU4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Myom3A2ABU4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
Myom3A2ABU4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Myom3A2ABU4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Myom3A2ABU4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Myom3A2ABU4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Myom3A2ABU4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Myom3A2ABU4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Myom3A2ABU4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
Myom3A2ABU4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
Myom3A2ABU4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Myom3A2ABU4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Myom3A2ABU4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Myom3A2ABU4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Myom3A2ABU4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Myom3A2ABU4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Myom3A2ABU4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Myom3A2ABU4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Myom3A2ABU4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Myom3A2ABU4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Myom3A2ABU4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Myom3A2ABU4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
Myom3A2ABU4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Myom3A2ABU4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Myom3A2ABU4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Myom3A2ABU4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
Myom3A2ABU4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Myom3A2ABU4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Myom3A2ABU4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Myom3A2ABU4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Myom3A2ABU4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC37.75■■■■□ 3.63
Myom3A2ABU4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Myom3A2ABU4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Myom3A2ABU4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Myom3A2ABU4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
Myom3A2ABU4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Myom3A2ABU4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Myom3A2ABU4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Myom3A2ABU4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Myom3A2ABU4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Myom3A2ABU4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Myom3A2ABU4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Myom3A2ABU4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Myom3A2ABU4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Myom3A2ABU4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Myom3A2ABU4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Myom3A2ABU4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC37.62■■■■□ 3.61
Myom3A2ABU4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Myom3A2ABU4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC37.6■■■■□ 3.61
Myom3A2ABU4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Myom3A2ABU4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Myom3A2ABU4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
Myom3A2ABU4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC37.57■■■■□ 3.6
Myom3A2ABU4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Myom3A2ABU4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Myom3A2ABU4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Myom3A2ABU4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Myom3A2ABU4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Myom3A2ABU4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms