Protein–RNA interactions for Protein: A2A7F4

Rlf, MCG122876, mousemouse

Predictions only

Length 1,918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RlfA2A7F4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RlfA2A7F4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RlfA2A7F4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RlfA2A7F4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RlfA2A7F4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RlfA2A7F4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RlfA2A7F4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RlfA2A7F4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RlfA2A7F4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RlfA2A7F4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
RlfA2A7F4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RlfA2A7F4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RlfA2A7F4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RlfA2A7F4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RlfA2A7F4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RlfA2A7F4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RlfA2A7F4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RlfA2A7F4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RlfA2A7F4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RlfA2A7F4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RlfA2A7F4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RlfA2A7F4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RlfA2A7F4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RlfA2A7F4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RlfA2A7F4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RlfA2A7F4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RlfA2A7F4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RlfA2A7F4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RlfA2A7F4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RlfA2A7F4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RlfA2A7F4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RlfA2A7F4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RlfA2A7F4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RlfA2A7F4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RlfA2A7F4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RlfA2A7F4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RlfA2A7F4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RlfA2A7F4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RlfA2A7F4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RlfA2A7F4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RlfA2A7F4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RlfA2A7F4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RlfA2A7F4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RlfA2A7F4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RlfA2A7F4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RlfA2A7F4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RlfA2A7F4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RlfA2A7F4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RlfA2A7F4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RlfA2A7F4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RlfA2A7F4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RlfA2A7F4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RlfA2A7F4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RlfA2A7F4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RlfA2A7F4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RlfA2A7F4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RlfA2A7F4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RlfA2A7F4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RlfA2A7F4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RlfA2A7F4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
RlfA2A7F4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RlfA2A7F4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RlfA2A7F4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RlfA2A7F4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
RlfA2A7F4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
RlfA2A7F4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RlfA2A7F4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RlfA2A7F4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RlfA2A7F4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RlfA2A7F4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RlfA2A7F4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RlfA2A7F4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RlfA2A7F4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RlfA2A7F4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RlfA2A7F4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RlfA2A7F4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RlfA2A7F4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RlfA2A7F4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RlfA2A7F4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RlfA2A7F4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RlfA2A7F4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RlfA2A7F4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RlfA2A7F4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RlfA2A7F4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RlfA2A7F4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RlfA2A7F4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RlfA2A7F4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RlfA2A7F4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RlfA2A7F4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RlfA2A7F4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RlfA2A7F4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RlfA2A7F4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RlfA2A7F4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RlfA2A7F4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RlfA2A7F4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RlfA2A7F4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RlfA2A7F4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
RlfA2A7F4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RlfA2A7F4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RlfA2A7F4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.2 ms