Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDU1

Uncharacterized protein, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A286YDU1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,54■■□□□ 1,36
A0A286YDU1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,54■■□□□ 1,36
A0A286YDU1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
A0A286YDU1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23,51■■□□□ 1,35
A0A286YDU1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
A0A286YDU1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
A0A286YDU1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
A0A286YDU1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23,49■■□□□ 1,35
A0A286YDU1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
A0A286YDU1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23,47■■□□□ 1,35
A0A286YDU1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
A0A286YDU1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
A0A286YDU1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
A0A286YDU1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
A0A286YDU1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
A0A286YDU1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23,43■■□□□ 1,34
A0A286YDU1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
A0A286YDU1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
A0A286YDU1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
A0A286YDU1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23,4■■□□□ 1,34
A0A286YDU1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
A0A286YDU1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
A0A286YDU1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
A0A286YDU1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
A0A286YDU1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
A0A286YDU1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
A0A286YDU1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23,36■■□□□ 1,33
A0A286YDU1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
A0A286YDU1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23,35■■□□□ 1,33
A0A286YDU1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,32■■□□□ 1,32
A0A286YDU1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
A0A286YDU1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
A0A286YDU1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23,3■■□□□ 1,32
A0A286YDU1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
A0A286YDU1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
A0A286YDU1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
A0A286YDU1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
A0A286YDU1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23,25■■□□□ 1,31
A0A286YDU1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23,24■■□□□ 1,31
A0A286YDU1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
A0A286YDU1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
A0A286YDU1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
A0A286YDU1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,22■■□□□ 1,31
A0A286YDU1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
A0A286YDU1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
A0A286YDU1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
A0A286YDU1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
A0A286YDU1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
A0A286YDU1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
A0A286YDU1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
A0A286YDU1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,17■■□□□ 1,3
A0A286YDU1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
A0A286YDU1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
A0A286YDU1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
A0A286YDU1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,13■■□□□ 1,29
A0A286YDU1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,12■■□□□ 1,29
A0A286YDU1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23,11■■□□□ 1,29
A0A286YDU1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
A0A286YDU1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
A0A286YDU1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
A0A286YDU1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23,1■■□□□ 1,29
A0A286YDU1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
A0A286YDU1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
A0A286YDU1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,08■■□□□ 1,29
A0A286YDU1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,07■■□□□ 1,28
A0A286YDU1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
A0A286YDU1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
A0A286YDU1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23,05■■□□□ 1,28
A0A286YDU1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23,04■■□□□ 1,28
A0A286YDU1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23,03■■□□□ 1,28
A0A286YDU1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,03■■□□□ 1,28
A0A286YDU1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
A0A286YDU1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
A0A286YDU1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,01■■□□□ 1,27
A0A286YDU1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
A0A286YDU1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22,98■■□□□ 1,27
A0A286YDU1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
A0A286YDU1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
A0A286YDU1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22,97■■□□□ 1,27
A0A286YDU1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
A0A286YDU1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
A0A286YDU1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
A0A286YDU1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
A0A286YDU1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
A0A286YDU1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22,93■■□□□ 1,26
A0A286YDU1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,91■■□□□ 1,26
A0A286YDU1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
A0A286YDU1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
A0A286YDU1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
A0A286YDU1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
A0A286YDU1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22,9■■□□□ 1,26
A0A286YDU1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,26
A0A286YDU1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22,87■■□□□ 1,25
A0A286YDU1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
A0A286YDU1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
A0A286YDU1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22,86■■□□□ 1,25
A0A286YDU1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
A0A286YDU1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
A0A286YDU1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
A0A286YDU1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7,5 ms